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Portal de la ciencia

Los portales científicos brindan acceso a recursos avanzados para investigadores, educadores y estudiantes de ciencia e ingeniería. A través de interfaces en línea simplificadas y fáciles de usar, los portales combinan una variedad de componentes de ciberinfraestructura (CI) en apoyo de un conjunto específico de herramientas, aplicaciones y recopilaciones de datos de la comunidad: [1] En general, estos recursos especializados y compartidos se integran como un portal web, una aplicación móvil o un conjunto de aplicaciones. [2] A través de portales científicos, amplias comunidades de investigadores pueden acceder a diversos recursos que pueden ahorrar tiempo y dinero para ellos y sus instituciones. [3] Como se enumera a continuación, las funciones y los recursos que ofrecen los portales científicos incluyen equipos e instrumentos compartidos, servicios computacionales, aplicaciones de software avanzadas, capacidades de colaboración, repositorios de datos y redes. [2]

Equipos e instrumentos compartidos

servicios computacionales

aplicaciones de software avanzadas

Capacidades de colaboración

repositorios de datos

redes

Historia

Durante décadas, los portales científicos existieron en diversas formas que en ese momento no se habrían llamado portales científicos, pero en la última década, más proyectos se han unido en torno al término. Por ejemplo, el Protein Data Bank [ 4] comenzó en 1971 y continúa brindando un servicio crucial para su comunidad.

Los portales científicos suelen tener otros nombres, según la comunidad o la región del mundo. Otros nombres alternativos son [5]

Algunas de las primeras pasarelas que proporcionaron interfaces simplificadas para la computación en red de alto rendimiento utilizaron la infraestructura informática TeraGrid con sede en EE. UU. , financiada por la National Science Foundation. TeraGrid (que ahora continúa bajo los auspicios del Extreme Science and Engineering Discovery Environment , o XSEDE) reunió a una comunidad diversa de desarrolladores de software, que de otro modo estarían aislados entre sí por campos de aplicación dispares. En Australia, el organismo de investigación electrónica NeCTAR proporciona recursos y soporte similares para las pasarelas. Con el crecimiento de esta comunidad en EE. UU., Europa y Australasia, varias series de talleres ayudaron a los creadores y usuarios de pasarelas a unirse en torno al concepto y formar una comunidad de práctica: Gateway Computing Environments (EE. UU., iniciado en 2005), International Workshop on Science Gateways (Europa, iniciado en 2009) y International Workshop on Science Gateways - Australia (iniciado en 2016).

Además, han proliferado los middleware para dar soporte a las pasarelas, entre los que se incluyen:

A medida que algunas de las primeras pasarelas (y otros recursos digitales) llegaban al final de su primer ciclo de financiación, los usuarios empezaron a ver que algunas de ellas cerraban por falta de financiación o por un progreso insuficiente en la creación de una herramienta sostenible; esto impulsó una mayor investigación sobre las claves de la sostenibilidad de dichos proyectos. [12] [13] Reconociendo la necesidad de reutilización de software e intercambio comunitario, la Fundación Nacional de Ciencias de Estados Unidos financió en 2016 el Science Gateways Community Institute [2] , que proporciona servicios y recursos subvencionados a los desarrolladores y usuarios de pasarelas científicas. A nivel internacional, la Coalición Internacional sobre Pasarelas Científicas reúne a organizaciones de varios países y continentes para compartir las mejores prácticas y las direcciones futuras en el campo.

Véase también

Referencias

  1. ^ Wilkins‐Diehr, Nancy. "Número especial: portales científicos: interfaces comunitarias comunes para recursos de red". Concurrency and Computation: Practice and Experience 19, no. 6 (2007): 743-749.
  2. ^ abc Lawrence, Katherine A., Michael Zentner, Nancy Wilkins‐Diehr, Julie A. Wernert, Marlon Pierce, Suresh Marru y Scott Michael. "Puertas de acceso a la ciencia hoy y mañana: perspectivas positivas de casi 5000 miembros de la comunidad de investigación", Concurrency and Computation: Practice and Experience 27, No. 16 (2015): 4252-4268.
  3. ^ Kiss, Tamas. "Puertas de acceso a la ciencia para una adopción más amplia de infraestructuras informáticas distribuidas". Journal of Grid Computing (2012): 1-2
  4. ^ Berman, HM (enero de 2008). "El banco de datos de proteínas: una perspectiva histórica" ​​(PDF). Acta Crystallographica Sección A. A64 (1): 88–95. PMID  18156675. doi:10.1107/S0108767307035623
  5. ^ Shahand, S. (2015). Portales científicos para el análisis de macrodatos biomédicos (tesis doctoral). Recuperado del Repositorio académico digital de la Universidad de Ámsterdam
  6. ^ Pierce, Marlon E., Suresh Marru, Lahiru Gunathilake, Don Kushan Wijeratne, Raminder Singh, Chathuri Wimalasena, Shameera Ratnayaka y Sudhakar Pmidighantam. "Apache Airavata: diseño y direcciones de un marco de acceso a la ciencia". Concurrencia y Computación: Práctica y Experiencia 27, no. 16 (2015): 4282-4291. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cpe.3534/full
  7. ^ Wang, Y., Kaplan, N., Newman, G., y Scarpino, R. "CitSci.org: Un nuevo modelo para gestionar, documentar y compartir datos científicos ciudadanos", PLoS Biology, vol. 13, (10), 2015. DOI: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.1002280.
  8. ^ Merchant, Nirav, et al., "The iPlant Collaborative: ciberinfraestructura para permitir el descubrimiento de datos para las ciencias de la vida", PLOS Biology (2016), doi: 10.1371/journal.pbio.1002342.
  9. ^ Goff, Stephen A., et al., "El iPlant Collaborative: Ciberinfraestructura para la biología vegetal", Frontiers in Plant Science 2 (2011), doi: 10.3389/fpls.2011.00034.
  10. ^ Enis Afgan, Dannon Baker, Marius van den Beek, Daniel Blankenberg, Dave Bouvier, Martin Čech, John Chilton, Dave Clements, Nate Coraor, Carl Eberhard, Björn Grüning, Aysam Guerler, Jennifer Hillman-Jackson, Greg Von Kuster, Eric Rasche, Nicola Soranzo, Nitesh Turaga, James Taylor, Anton Nekrutenko y Jeremy Goecks. La plataforma Galaxy para análisis biomédicos accesibles, reproducibles y colaborativos: actualización de 2016. Nucleic Acids Research (2016) 44(W1): W3-W10 doi:10.1093/nar/gkw343
  11. ^ M. McLennan, R. Kennell, "HUBzero: una plataforma para la difusión y colaboración en ciencia e ingeniería computacional", Computing in Science and Engineering, 12(2), págs. 48-52, marzo/abril de 2010.
  12. ^ Maron, Nancy L., K. Kirby Smith y Matthew Loy. "Sostener recursos digitales: una visión sobre el terreno de los proyectos actuales". Ithaka S+R. Última modificación: 14 de julio de 2009. https://doi.org/10.18665/sr.22408.
  13. ^ Wilkins-Diehr, N. y KA Lawrence (2010) “Abriendo puertas científicas al éxito futuro: los desafíos de la sostenibilidad de las puertas de enlace”, Gateway Computing Environments Workshop (GCE), 2010, págs. 1-10; 14 de noviembre de 2010. IEEE Computer Society (Xplore Digital Library). doi: 10.1109/GCE.2010.5676121.