Podoviridae era una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales, a menudo asociados con fagos similares a T-7. [1] La familia y el orden Caudovirales han sido abolidos y ahora se utiliza el término podovirus para referirse a la morfología de los virus de esta antigua familia. [2] Había 130 especies en esta familia, asignadas a 3 subfamilias y 52 géneros. [3] [4] Esta familia se caracterizaba por tener colas muy cortas y no contráctiles. Muchos fagos anteriores de la antigua familia Podoviriade ahora se clasifican en Autographiviridae.
Los virus de la antigua familia Podoviridae no tienen envoltura, tienen geometrías icosaédricas y de cabeza-cola. El diámetro es de alrededor de 60 nm, [3] y consta de 72 capsómeros. La proteína de la cabeza tiene una masa molecular de ~38 kilodaltons y está presente en 460 copias por virión. Hay 9 proteínas estructurales. La cola no es contráctil y tiene 6 fibras subterminales cortas. Es gruesa y tiene forma de bastón y está formada por discos apilados. La longitud máxima es de ~17 nm. [ cita requerida ]
El genoma de ADN de doble cadena es lineal, de alrededor de 40-42 kb de longitud, [3] y codifica ~55 genes. El contenido de guanina + citosina es ~50%. Tiene secuencias redundantes terminales y no está permutado. En peso, el genoma constituye ~50% del virón. El genoma codifica 9 proteínas estructurales, una ADN polimerasa de tipo B de transferasa adenilada y una ARN polimerasa. Tres proteínas internas constituyen el complejo de polimerasa. Se reconocen dos clases de genes (tempranos y tardíos). Esta clasificación se basa en el momento de la transcripción que se regula temporalmente. Los genes con funciones relacionadas se agrupan. La replicación del genoma es bidireccional. [ cita requerida ]
La replicación viral es citoplasmática. La entrada en la célula huésped se logra por adsorción en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de desplazamiento de la cadena de ADN. La transcripción basada en ADN es el método de transcripción. El virus sale de la célula huésped por lisis y las proteínas holina/endolisina/spanina. Las bacterias sirven como huésped natural. Las vías de transmisión son la difusión pasiva. [3] La infección por fagos se considera autodosificante, por lo tanto, autolimitante. Después de la lisis del huésped, los nuevos fagos desencadenan un nuevo ciclo de infección con las especies huésped biodisponibles circundantes, lo que da como resultado el crecimiento y la expansión. [5]
Los géneros de esta familia tienen aproximadamente un 40 % de identidad entre las proteínas correspondientes. Las subfamilias tienen aproximadamente un 20 % de identidad entre las proteínas correspondientes.
Se reconocen las siguientes subfamilias y sus géneros (- virinae denota subfamilia y - virus denota género): [4]
Los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [4]
Por último, la especie Pseudomonas virus 119X no está asignada a un género o subfamilia. [4]
