La temporada 2004 de fútbol americano de la División I-AA de la NCAA , parte del fútbol americano universitario en los Estados Unidos organizado por la Asociación Nacional de Atletismo Universitario en el nivel División I-AA , comenzó el 28 de agosto de 2004 y concluyó con el Juego del Campeonato de Fútbol Americano de la División I-AA de la NCAA 2004 el 17 de diciembre de 2004, en el Estadio Finley en Chattanooga, Tennessee . James Madison ganó su primer campeonato I-AA, derrotando a Montana por un marcador final de 31-21.
* Indica institución anfitriona