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Ontología vegetal

La ontología vegetal (PO) es una colección de ontologías desarrolladas por el Consorcio de Ontología Vegetal. Estas ontologías describen estructuras anatómicas y etapas de crecimiento y desarrollo en Viridiplantae . [2] [3] [4] [5] [6] [7] La ​​PO está destinada a múltiples aplicaciones, incluidas la genética , la genómica , la fenómica y el desarrollo , la taxonomía y la sistemática , las aplicaciones semánticas y la educación. [1] [8]

Miembros del proyecto

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Walls, RL; Athreya, B.; Cooper, L.; Elser, J.; Gandolfo, MA; Jaiswal, P.; Mungall, CJ; Preece, J.; Rensing, S.; Smith, B.; Stevenson, DW (2012). "Ontologías como herramientas integradoras para la ciencia vegetal". American Journal of Botany . 99 (8): 1263–1275. doi :10.3732/ajb.1200222. PMC  3492881 . PMID  22847540.
  2. ^ ab The Plant Ontology Consortium, C. (2002). "El Consorcio de Ontología Vegetal™ y las Ontologías Vegetales". Genómica Comparativa y Funcional . 3 (2): 137–142. doi :10.1002/cfg.154. PMC 2447263 . PMID  18628842. 
  3. ^ Ilic, Katica (2008). Albert, Burger (ed.). Plant Structure Ontology (PSO) - A morphological and anatomical ontology of flowers plants (Ontología de la estructura de las plantas (PSO) - Una ontología morfológica y anatómica de las plantas con flores). Springer. pp. 27–42 . Consultado el 22 de agosto de 2012 .
  4. ^ Avraham, S.; Tung, C. -W.; Ilic, K.; Jaiswal, P.; Kellogg, EA; McCouch, S .; Pujar, A.; Reiser, L.; Rhee, SY; Sachs, MM; Schaeffer, M.; Stein, L.; Stevens, P.; Vincent, L.; Zapata, F.; Ware, D. (2007). "La base de datos de ontología de plantas: un recurso comunitario para el vocabulario y las anotaciones controladas sobre la estructura de las plantas y las etapas de desarrollo". Nucleic Acids Research . 36 (número de la base de datos): D449–D454. doi :10.1093/nar/gkm908. PMC 2238838 . PMID  18194960. 
  5. ^ Ilic, K.; Kellogg, EA; Jaiswal, P.; Zapata, F.; Stevens, PF; Vincent, LP; Avraham, S.; Reiser, L.; Pujar, A.; Sachs, MM; Whitman, NT; McCouch, SR; Schaeffer, ML; Ware, DH; Stein, LD; Rhee, SY (2006). "La ontología de la estructura de la planta, un vocabulario unificado de anatomía y morfología de una planta con flores". Fisiología vegetal . 143 (2): 587–599. doi :10.1104/pp.106.092825. PMC 1803752 . PMID  17142475. 
  6. ^ Pujar, A.; Jaiswal, P.; Kellogg, EA; Ilic, K.; Vincent, L.; Avraham, S.; Stevens, P.; Zapata, F.; Reiser, L.; Rhee, SY; Sachs, MM; Schaeffer, M.; Stein, L.; Ware, D.; McCouch, S. (2006). "Ontología de la etapa de crecimiento de toda la planta para angiospermas y su aplicación en biología vegetal". Fisiología vegetal . 142 (2): 414–428. doi :10.1104/pp.106.085720. PMC 1586063 . PMID  16905665. 
  7. ^ Jaiswal, P.; Avraham, S.; Ilic, K.; Kellogg, EA; McCouch, S.; Pujar, A.; Reiser, L.; Rhee, SY; Sachs, MM; Schaeffer, M.; Stein, L.; Stevens, P.; Vincent, L.; Ware, D.; Zapata, F. (2005). "Ontología vegetal (PO): un vocabulario controlado de estructuras vegetales y etapas de crecimiento". Genómica comparativa y funcional . 6 (7–8): 388–397. doi :10.1002/cfg.496. PMC 2447502 . PMID  18629207. 
  8. ^ "Sobrecarga de información en la era del 'Big Data'". Science Daily . Consultado el 23 de agosto de 2012 .

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