stringtranslate.com

Sistema de transposón PiggyBac

El sistema de transposón PiggyBac (PB) emplea una enzima transposasa diseñada genéticamente para insertar un gen en el genoma de una célula. Está construido sobre el elemento transponible natural PiggyBac (PB) (transposón), lo que permite el movimiento de ida y vuelta de genes entre cromosomas y vectores genéticos como plásmidos a través de un mecanismo de "cortar y pegar". Durante la transposición, la transposasa PB reconoce secuencias de repetición terminal invertida (ITR) específicas del transposón ubicadas en ambos extremos del vector del transposón y mueve eficientemente el contenido desde los sitios originales y los integra en sitios cromosómicos TTAA. La poderosa actividad del sistema de transposón PiggyBac permite que los genes de interés entre las dos ITR en el vector PB se movilicen fácilmente en genomas objetivo. El transposón piggyBac específico de TTAA se está convirtiendo rápidamente en un transposón muy útil para la ingeniería genética de una amplia variedad de especies, particularmente insectos. [1] Fueron descubiertos en 1989 por Malcolm Fraser en la Universidad de Notre Dame . [2] [3]

Origen

Los elementos de repetición corta específicos de TTAA son un grupo de transposones que comparten similitudes en cuanto a estructura y propiedades de movimiento. Estos elementos se definieron originalmente en la oruga de la col [4] , pero parecen ser comunes también entre otros animales. Podrían resultar herramientas útiles para la transformación de insectos. La identificación original de estos inusuales elementos específicos de TTAA se produjo a través de una ruta poco convencional en relación con la mayoría de los demás elementos móviles de la Clase II. Se observó que los mutantes de morfología de placa espontánea de los baculovirus surgían durante la propagación de estos virus en la línea celular TN-368. La caracterización genética de estas mutaciones a menudo reveló una inserción asociada de ADN derivados del huésped, algunos de los cuales parecían ser transposones.

Se han identificado varias inserciones de ADN hospedador móviles diferentes dentro del locus de pocos poliedros (FP) de los baculovirus AcMNPV y GmMNPV. Las inserciones estudiadas más extensamente son las que ahora se denominan tagalong (anteriormente TFP3) y piggyBac (anteriormente IFP2). Estas inserciones muestran una preferencia única por los sitios diana de TTAA, ya sea insertándose dentro del locus FP viral o en otras regiones del genoma viral. Ambos elementos son parte de una familia más grande de elementos de inserción específicos del sitio diana de TTAA que incluye los elementos piggyBac y tagalong derivados de T. ni, los elementos derivados de Spodoptera frugiperda IFP1.6 y la inserción de 290 pb de Carstens, y la inserción similar a un transposón dentro de la región EcoRI-J,N del virus de la polihedrosis nuclear de Autographa californica, cuyo origen no está definido.

Más recientemente, el análisis de secuencias obtenidas del genoma humano ha revelado lo que parecen ser entre 100 y 500 copias de un elemento fósil llamado LOOPER, que tiene homología de secuencia con piggyBac, termina en 5' CCY....GGG 3' y aparentemente se dirige a sitios de inserción de TTAA. La secuencia de consenso de LOOPER es en promedio un 77% similar a secuencias individuales identificadas en el genoma humano, lo que indica que tiene al menos 60 millones de años. Hay otros dos elementos de repetición fósil específicos de TTAA, MER75 y MER85 (se estima que hay 2000 copias por genoma) que parecen dirigirse a sitios de inserción de TTAA y terminan en 5' CCC...GGG 3'. Se están acumulando evidencias que sugieren que existe una superfamilia de elementos móviles específicos de TTAA en una diversidad de organismos, y que las secuencias relacionadas con piggyBac pueden estar presentes en una diversidad de especies. [5]

Estructura

El transposón consiste en el gen de la transposasa flanqueado por repeticiones terminales invertidas.

La transposasa de la superfamilia PB consta de tres dominios, un dominio N-terminal variable, un dominio de tríada DDE catalítico y una región C-terminal con la señal de localización nuclear. [6]

Al parecer, se ha domesticado en una amplia gama de animales, perdiendo las repeticiones y, por lo tanto, su movilidad. Las nuevas funciones que adquieren estas copias son a veces lo suficientemente significativas como para mostrar signos de selección positiva o purificadora. En los humanos, estos genes son: [7]

Como herramienta

Las versiones hiperactivas de la transposasa PiggyBac son adecuadas para fines de ingeniería genética. [8] Se creó una versión llamada mPB optimizando el uso de codones para mamíferos (ratón) con un aumento de 20 veces en la actividad, [9] y una detección de mutaciones adicional generó hyPB con 10 veces la actividad de mPB. [10] El sistema PiggyBac se ha empleado con éxito para expresar secuencias genéticas grandes, como un sistema de interferencia CRISPR inducible por doxiciclina. [11]

Un nuevo miembro de la transposasa hiperactiva Mage (MG) de la familia piggyBac (hyMagease) exhibió una fuerte transponibilidad en una variedad de células de mamíferos y células T primarias y una preferencia de inserción más débil por genes cercanos, sitios de inicio de transcripción, islas CpG y sitios hipersensibles a DNasa I en comparación con piggyBac. [12]

Nomenclatura

Estos elementos fueron identificados por primera vez como inserciones en mutantes de Baculovirus por el Dr. Malcolm Fraser, [5] profesor de la Universidad de Notre Dame , y originalmente fueron denominados IFP (inserciones en mutantes FP). Luego el nombre fue cambiado a TFP (transposón en FP). Finalmente se adoptó el nombre PiggyBac para mantener el interés de la audiencia y para guardar cierta semejanza con la nomenclatura de los genes de Drosophila .

Véase también

Referencias

  1. ^ "Sistema de transposón Piggybac". Lonza . Archivado desde el original el 30 de julio de 2019.
  2. ^ Cary LC, Goebel M, Corsaro BG, Wang HG, Rosen E, Fraser MJ (septiembre de 1989). "Mutagénesis de transposones de baculovirus: análisis de inserciones del transposón IFP2 de Trichoplusia ni dentro del locus FP de virus de polihedrosis nuclear". Virology . 172 (1): 156–169. doi :10.1016/0042-6822(89)90117-7. PMID  2549707.
  3. ^ Chen Q, Luo W, Veach RA, Hickman AB, Wilson MH, Dyda F (julio de 2020). "Base estructural de la escisión sin fisuras y la focalización específica por la transposasa piggyBac". Nature Communications . 11 (1): 3446. Bibcode :2020NatCo..11.3446C. doi : 10.1038/s41467-020-17128-1 . PMC 7351741 . PMID  32651359. 
  4. ^ Fraser MJ, Smith GE, Summers MD (agosto de 1983). "Adquisición de secuencias de ADN de células huésped por baculovirus: relación entre inserciones de ADN huésped y mutantes FP de virus de polihedrosis nuclear de Autographa californica y Galleria mellonella". Journal of Virology . 47 (2): 287–300. doi :10.1128/JVI.47.2.287-300.1983. PMC 255260 . PMID  16789244. 
  5. ^ de Fraser Jr MJ. "PiggyBac". Universidad de Notre Dame. Archivado desde el original el 20 de enero de 2012.
  6. ^ Sarkar A, Sim C, Hong YS, Hogan JR, Fraser MJ, Robertson HM, et al. (noviembre de 2003). "Análisis evolutivo molecular de la familia de transposones piggyBac ampliamente distribuida y secuencias "domesticadas" relacionadas". Genética molecular y genómica . 270 (2): 173–80. doi :10.1007/s00438-003-0909-0. PMID  12955498. S2CID  16272611.
  7. ^ Bouallègue M, Rouault JD, Hua-Van A, Makni M, Capy P (febrero de 2017). "Evolución molecular de la superfamilia piggyBac: del egoísmo a la domesticación". Genome Biology and Evolution . 9 (2): 323–339. doi :10.1093/gbe/evw292. PMC 5381638 . PMID  28082605. 
  8. ^ Grabundzija I, Irgang M, Mátés L, Belay E, Matrai J, Gogol-Döring A, et al. (junio de 2010). "Análisis comparativo de sistemas de vectores de elementos transponibles en células humanas". Terapia molecular . 18 (6): 1200–9. doi :10.1038/mt.2010.47. PMC 2889740 . PMID  20372108. 
  9. ^ Cadiñanos J, Bradley A (2007). "Generación de un sistema de transposones piggyBac inducible y optimizado". Nucleic Acids Research . 35 (12): e87. doi :10.1093/nar/gkm446. PMC 1919496 . PMID  17576687. 
  10. ^ Yusa K, Zhou L, Li MA, Bradley A, Craig NL (enero de 2011). "Una transposasa piggyBac hiperactiva para aplicaciones en mamíferos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (4): 1531–6. Bibcode :2011PNAS..108.1531Y. doi : 10.1073/pnas.1008322108 . PMC 3029773 . PMID  21205896. 
  11. ^ De Rosa P, Severi F, Zadran SK, Russo M, Aloisi S, Rigamonti A, et al. (enero de 2023). "La amplificación de MYCN, junto con la expresión de RB1 de tipo salvaje, mejora la eficacia de los inhibidores de CDK4/6 en células de neuroblastoma". Revista internacional de ciencias moleculares . 24 (6): 5408. doi : 10.3390/ijms24065408 . ISSN  1422-0067. PMC 10049239 . PMID  36982482. 
  12. ^ Tian J, Tong D, Li Z, Wang E, Yu Y, Lv H, et al. (marzo de 2024). "Transposón Mage: un nuevo sistema de administración de genes para células de mamíferos". Nucleic Acids Research . 52 (5): 2724–2739. doi :10.1093/nar/gkae048. PMC 10954464 . PMID  38300794.  Este artículo incorpora texto de esta fuente, que está disponible bajo la licencia CC BY 4.0.