[1] Procede de la cantera del FC Copenhague, más tarde se unió al Brøndby IF en el año 2010 y fue traspasado al F.C.
FC Nuremberg con 17 años y 251 días siendo así el jugador más joven en jugar para el primer equipo del Bayern de Múnich.
[2] En julio de 2016, pasó a la Premier League para el FC Southampton.
El 11 de agosto, se anunció que Højbjerg había sido transferido al Tottenham, en un intercambio con el Southampton que incluía el pase de Kyle Walker-Peters más £3 millones.
El sábado 22 de agosto, Højbjerg debutó con los Spurs en un partido amistoso contra el Ipswich Town, en el que jugó toda la primera mitad y contribuyó al segundo gol del Tottenham, tras interceptar un pase del arquero del Ipswich y darle la pelota a Dele Alli, quién asistió el gol para Heung-Min Son en el minuto 10.