Pablo Babitzke

Profesor de biología estadounidense

Paul Babitzke es profesor de bioquímica y biología molecular y director del Centro de Biología Molecular del ARN en la Universidad Estatal de Pensilvania . ^{[1] [2]}

Educación

Paul Babitzke obtuvo su licenciatura en ciencias biomédicas en la Universidad Estatal de St. Cloud en Minnesota en 1994. ^[3] Obtuvo su doctorado en genética en la Universidad de Georgia en 1991. ^[1]

Carrera

Antes de comenzar a trabajar en la Universidad Estatal de Pensilvania en 1994, Babitzke trabajó como científico postdoctoral en el departamento de ciencias biológicas de la Universidad de Stanford durante tres años. ^[3] Actualmente, es profesor de bioquímica y biología molecular en la Universidad Estatal de Pensilvania. ^[1]

Se convirtió en profesor asistente de bioquímica y biología molecular en 1994 y profesor asociado en 2000. En 2006, Babitzke fue ascendido a profesor titular. ^[4]

Desde 2009, se desempeña como director del Centro de Biología Molecular del ARN en los Institutos Huck de Ciencias de la Vida de Penn State. ^[5] Su investigación se centra en la regulación de la expresión genética mediada por la pausa de la ARN polimerasa, la terminación de la transcripción, la estructura del ARN y las proteínas de unión al ARN.

En 2016, fue elegido miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia. ^[1]

En 2017, fue elegido miembro de la Academia Estadounidense de Microbiología. ^[1]

Honores y premios

• Presidente de la División H de la Sociedad Estadounidense de Microbiología (ASM) (2006) ^[3]
• Presidente del subcomité 2 de Fisiología y Genética Microbiana del NIGMS (MBC-2) (2004) ^[3]
• Premio a la docencia Daniel R. Tershak (2009) ^[3]
• Representante del Grupo Divisional IV, Sociedad Estadounidense de Microbiología (ASM) (2011-2015) ^[3]
• Premio de investigación de la nueva iniciativa Charles E. Kaufman (2016) ^[3]
• Miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia (AAAS) (2016) ^[6]
• Miembro de la Academia Estadounidense de Microbiología (AAM) (2017) ^[3]
• Premio al alumno destacado de Ciencias Biológicas de la Universidad Estatal de St. Cloud (2018) ^[3]

Publicaciones seleccionadas

• Baker, CS, Morozov, I., Suzuki, K., Romeo, T. y Babitzke, P. (2002) CsrA regula la biosíntesis de glucógeno al impedir la traducción de glgC en Escherichia coli. Mol. Microbiol. 44:1599-1610. ^[7]
• Yakhnin, AV y Babitzke, P. (2002) La pausa y terminación de la ARN polimerasa estimulada por NusA participa en el mecanismo de atenuación del operón trp de Bacillus subtilis in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99:11067-11072. ^[8]
• Yakhnin, AV, Yakhnin, H. y Babitzke, P. (2006) La pausa de la ARN polimerasa participa en el mecanismo de control de la traducción de trpE de Bacillus subtilis al proporcionar tiempo adicional para que TRAP se una a la transcripción líder de trp naciente . Mol. Cell 24:547-557. ^[9]
• Yakhnin, AV, Yakhnin, H. y Babitzke, P. (2008) Función del factor de elongación de transcripción NusG de Bacillus subtilis en la ARN polimerasa dependiente de horquilla que se detiene en el líder trp . Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105:16131-16136. ^[10]
• Yakhnin, H., Yakhnin, AV, Baker, CS, Sineva, E., Berezin, I., Romeo, T. y Babitzke, P. (2011) Regulación compleja del gen regulador global csrA : represión traduccional mediada por CsrA, transcripción de cinco promotores por Es ⁷⁰ y Es ^S y activación transcripcional indirecta por CsrA. Mol. Microbiol. 81:689-704. ^[11]
• Yakhnin, AV, Baker, CS, Vakulskas, CA, Yakhnin, H., Berezin, I., Romeo, T. y Babitzke, P. (2013) CsrA activa la expresión de flhDC protegiendo el ARNm de flhDC de la escisión mediada por RNasa E. Mol. Microbiol. 87:851-866. ^[12]
• Mondal, S., Yakhnin, AV, Sebastian, A., Albert, I. y Babitzke, P. (2016) La terminación de la transcripción dependiente de NusA previene la regulación incorrecta de la expresión génica global. Nat. Microbiol. 1:15007. ^[13]
• Potts, AH, Vakulskas, CA, Pannuri, A., Yakhnin, H., Babitzke, P. y Romeo, T. (2017) Función global del regulador postranscripcional bacteriano CsrA revelada por transcriptómica integrada. Nat. Commun. 8:1596. ^[14]
• Yakhnin, AV, FitzGerald, PC, McIntosh, C., Yakhnin, H., Kireeva, M., Turek-Herman, J., Mandell, ZF, Kashlev, M. y Babitzke, P. (2020) NusG controla la pausa de la transcripción y la translocación de la ARN polimerasa en todo el genoma de Bacillus subtilis . Proc. Natl. Acad. Sci. USA 117:21628-21636. ^[15]
• Mandell, ZF, Oshiro, RT, Yakhnin, AV, Kashlev, M., Kearns, DB y Babitzke, P. (2021) NusG es un factor de terminación de transcripción intrínseco que estimula la motilidad y coordina la expresión genética con NusA. eLife 10:e61880. ^[16]

Referencias

1. "Paul Babitzke elegido miembro de la Academia Estadounidense de Microbiología". psu.edu . Consultado el 4 de abril de 2017 .
2. "Paul Babitzke". psu.edu . Consultado el 4 de abril de 2017 .
3. "Paul Babitzke - Eberly College of Science". science.psu.edu . Consultado el 1 de octubre de 2019 .
4. "Lab Alumni". sites.psu.edu . Consultado el 22 de mayo de 2019 .
5. "Paul Babitzke". www.huck.psu.edu . Consultado el 17 de agosto de 2020 .
6. "Profesor Brian Thomas - Personal Psu - Penn State" www.personal.psu.edu . Consultado el 1 de noviembre de 2016 .
7. Baker, Carol S.; Morozov, Igor; Suzuki, Kazushi; Romeo, Tony; Babitzke, Paul (junio de 2002). "CsrA regula la biosíntesis de glucógeno al impedir la traducción de glgC en Escherichia coli". Microbiología molecular . 44 (6): 1599–1610. doi :10.1046/j.1365-2958.2002.02982.x. ISSN  0950-382X. PMID  12067347. S2CID  34798274.
8. Yakhnin, Alexander V.; Babitzke, Paul (20 de agosto de 2002). "La pausa y terminación de la ARN polimerasa estimulada por NusA participa en el mecanismo de atenuación del operón trp de Bacillus subtilis in vitro". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 99 (17): 11067–11072. Bibcode :2002PNAS...9911067Y. doi : 10.1073/pnas.162373299 . ISSN  0027-8424. PMC 123211 . PMID  12161562. 
9. Yakhnin, Alexander V.; Yakhnin, Helen; Babitzke, Paul (17 de noviembre de 2006). "La pausa de la ARN polimerasa regula la iniciación de la traducción al proporcionar tiempo adicional para la interacción TRAP-ARN". Molecular Cell . 24 (4): 547–557. doi : 10.1016/j.molcel.2006.09.018 . ISSN  1097-2765. PMID  17114058.
10. Yakhnin, Alexander V.; Yakhnin, Helen; Babitzke, Paul (21 de octubre de 2008). "Función del factor de elongación de transcripción NusG de Bacillus subtilis en la ARN polimerasa dependiente de horquilla que se detiene en el líder trp". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 105 (42): 16131–16136. Bibcode :2008PNAS..10516131Y. doi : 10.1073/pnas.0808842105 . ISSN  1091-6490. PMC 2571025 . PMID  18852477. 
11. Yakhnin, Helen; Yakhnin, Alexander V.; Baker, Carol S.; Sineva, Elena; Berezin, Igor; Romeo, Tony; Babitzke, Paul (agosto de 2011). "Regulación compleja del gen regulador global csrA: represión traduccional mediada por CsrA, transcripción de cinco promotores por Eσ70 y Eσ(S), y activación transcripcional indirecta por CsrA". Microbiología molecular . 81 (3): 689–704. doi :10.1111/j.1365-2958.2011.07723.x. ISSN  1365-2958. PMC 3189700 . PMID  21696456. 
12. Yakhnin, Alexander V.; Baker, Carol S.; Vakulskas, Christopher A.; Yakhnin, Helen; Berezin, Igor; Romeo, Tony; Babitzke, Paul (febrero de 2013). "CsrA activa la expresión de flhDC al proteger el ARNm de flhDC de la escisión mediada por la ARNasa E". Microbiología molecular . 87 (4): 851–866. doi :10.1111/mmi.12136. ISSN  0950-382X. PMC 3567230 . PMID  23305111. 
13. Mondal, Smarajit; Yakhnin, Alexander V.; Sebastian, Aswathy; Albert, Istvan; Babitzke, Paul (11 de enero de 2016). "La terminación de la transcripción dependiente de NusA previene la desregulación de la expresión génica global". Nature Microbiology . 1 : 15007. doi :10.1038/nmicrobiol.2015.7. ISSN  2058-5276. PMC 5358096 . PMID  27571753. 
14. Potts, Anastasia H.; Vakulskas, Christopher A.; Pannuri, Archana; Yakhnin, Helen; Babitzke, Paul; Romeo, Tony (17 de noviembre de 2017). "El papel global del regulador postranscripcional bacteriano CsrA revelado por transcriptómica integrada". Nature Communications . 8 (1): 1596. Bibcode :2017NatCo...8.1596P. doi :10.1038/s41467-017-01613-1. ISSN  2041-1723. PMC 5694010 . PMID  29150605. 
15. Yakhnin, AV; Fitzgerald, PC; McIntosh, C.; Yakhnin, H.; Kireeva, M.; Turek-Herman, J.; Mandell, ZF; Kashlev, M.; Babitzke, P. (2020). "PMC de Europa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 117 (35): 21628–21636. doi : 10.1073/pnas.2006873117 . PMC 7474616 . PMID  32817529. 
16. Mandell, Zachary F.; Oshiro, Reid T.; Yakhnin, Alexander V.; Vishwakarma, Rishi; Kashlev, Mikhail; Kearns, Daniel B.; Babitzke, Paul (9 de abril de 2021). "NusG es un factor de terminación de transcripción intrínseco que estimula la motilidad y coordina la expresión génica con NusA". eLife . 10 . doi : 10.7554/eLife.61880 . PMC 8060035 . PMID  33835023.