Tecnologías de nanoporos de Oxford

Empresa de secuenciación de nanoporos con sede en el Reino Unido

Oxford Nanopore Technologies plc es una empresa con sede en el Reino Unido que desarrolla y vende productos de secuenciación de nanoporos (incluido el secuenciador de ADN portátil, MinION) para el análisis electrónico directo de moléculas individuales . ^{[2] [3] [4]}

Historia

La empresa fue fundada en 2005 como una escisión de la Universidad de Oxford por Hagan Bayley , ^[5] Gordon Sanghera y Spike Willcocks, con financiación inicial del IP Group . ^[6] La empresa realizó una oferta pública inicial en la Bolsa de Valores de Londres el 30 de septiembre de 2021, bajo el símbolo ONT. ^[7]

En marzo de 2016, la empresa anunció una mejora química de su producto de secuenciación de nanoporos 'R9', utilizando un nanoporo de proteínas en colaboración con el laboratorio de Han Remaut (VIB/ Vrije Universiteit Brussel ). ^[8] La empresa declaró en un webcast que R9 está diseñado para mejorar las tasas de error y el rendimiento. ^[9]

La astronauta estadounidense Kate Rubins con un secuenciador MinION en la ISS en agosto de 2016.

En julio de 2016, un secuenciador de nanoporos MinION se incluyó en la novena misión de servicios de reabastecimiento de carga comercial de la NASA/ SpaceX a la Estación Espacial Internacional . ^[10] El objetivo de la misión era proporcionar una prueba de concepto de la funcionalidad del MinION en un entorno de microgravedad. ^[11] Durante la misión, los miembros de la tripulación de la ISS secuenciaron con éxito ADN de bacterias, bacteriófagos y roedores a partir de muestras preparadas en la Tierra. ^[12] Mantener el dispositivo MinION como una instalación de investigación en la estación espacial tiene el potencial de respaldar una serie de investigaciones científicas adicionales, cualquiera de las cuales podría tener aplicaciones basadas en la Tierra. ^[13]

Productos

Vista superior de un secuenciador MinION de Oxford Nanopore Technologies cerrado que muestra lo pequeño que es para sostenerlo con una mano

Los principales productos de Oxford Nanopore son:

• MinION: ^{[3] [14] [15]} este dispositivo USB portátil de secuenciación de proteínas por nanoporos del tamaño de una armónica está disponible comercialmente desde mayo de 2015 ^[16] después de haber sido lanzado inicialmente a través de un programa de acceso temprano, el Programa de Acceso MinION (MAP). ^[17]
• GridION X5: este dispositivo de escritorio está disponible comercialmente desde marzo de 2017. ^[18] El dispositivo procesa hasta cinco celdas de flujo MinION y permite la generación de hasta 100 Gb de datos por ejecución. ^[19]
• PromethION: este dispositivo de escritorio de alto rendimiento estará disponible a través de un programa de acceso ^[20] que se abrió para registro en julio de 2015. El dispositivo contiene canales para 144.000 nanoporos (en comparación con los 512 de MinION). ^[21]
• VolTRAX: este dispositivo, actualmente en desarrollo, está diseñado para la preparación automatizada de muestras, de modo que los usuarios no necesitan un laboratorio ni conocimientos de laboratorio para operar el dispositivo. ^[22] La inscripción para el programa de acceso temprano se abrió en octubre de 2016. ^[23]
• Metrichor: esta empresa derivada de Oxford Nanopore se creó para proporcionar soluciones integrales para análisis biológicos, utilizando tecnologías de detección de nanoporos. ^{[24] [25]}
• SmidgION: un secuenciador de teléfonos móviles anunciado en mayo de 2016, actualmente en desarrollo. ^[26]

Estos productos están destinados a ser utilizados para el análisis de ADN , ARN , proteínas y moléculas pequeñas con una variedad de aplicaciones en medicina personalizada , ciencia de cultivos e investigación científica. ^{[3] [27]}

Referencias

1. "Resultados anuales del año finalizado el 31 de diciembre de 2023" (PDF) . Oxford Nanopore Technologies . Consultado el 4 de septiembre de 2024 .
2. Eisenstein, M. (2012). "El anuncio de Oxford Nanopore genera revuelo en el sector de la secuenciación". Nature Biotechnology . 30 (4): 295–6. doi :10.1038/nbt0412-295. PMID  22491260. S2CID  205267199.
3. Mikheyev, AS; Tin, MMY (2014). "Un primer vistazo al secuenciador Oxford Nanopore MinION". Recursos de ecología molecular . 14 (6): 1097–102. doi :10.1111/1755-0998.12324. PMID  25187008. S2CID  3674911.
4. Loman, NJ; Quinlan, AR (2014). "Poretools: Un conjunto de herramientas para analizar datos de secuencias de nanoporos". Bioinformática . 30 (23): 3399–401. doi :10.1093/bioinformatics/btu555. PMC 4296151 . PMID  25143291. 
5. "BAYLEY, Prof. (John) Hagan (Pryce)" . Quién es quién . Vol. 2015 (edición en línea a través de Oxford University Press  ed.). A & C Black. (Se requiere suscripción o membresía a una biblioteca pública del Reino Unido).
6. "Secuenciación de ADN: toda la historia". The Economist . Londres. 16 de octubre de 2008. Consultado el 19 de octubre de 2014 .
7. "La Bolsa de Londres da la bienvenida a Oxford Nanopore Technologies plc al mercado principal". 11 de octubre de 2021.
8. "VIB anuncia colaboración con Oxford Nanopore Technologies en un nuevo nanoporo para secuenciación de ADN" . Consultado el 9 de mayo de 2016 .
9. "No gracias, ya tengo uno". YouTube . Consultado el 9 de mayo de 2016 .
10. Ramsey, Sarah (21 de junio de 2016). "El próximo lanzamiento de carga comercial de SpaceX no se realizará antes del 18 de julio" . Consultado el 25 de julio de 2016 .
11. "Secuenciación de ADN en el espacio - SpaceRef". spaceref.com . Consultado el 25 de julio de 2016 .
12. Rainey, Kristine (29 de agosto de 2016). «La primera secuenciación de ADN en el espacio cambia las reglas del juego». NASA . Consultado el 17 de octubre de 2016 .
13. McIntyre, Alexa BR; Rizzardi, Lindsay; Yu, Ángela M.; Rosen, Gail L.; Alejandro, Noé; Botkin, Douglas J.; Juan, Kristen K.; Castro-Wallace, Sarah L.; Burton, Aaron S. (10 de diciembre de 2015). "Secuenciación de nanoporos en microgravedad". bioRxiv 10.1101/032342 . 
14. Check Hayden, E. (2014). "Datos de un secuenciador de genoma de bolsillo revelados". Nature . doi : 10.1038/nature.2014.14724 .
15. Check Hayden, E. (2015). "Un secuenciador de ADN de tamaño reducido impresiona a los primeros usuarios". Nature . 521 (7550): 15–6. Bibcode :2015Natur.521...15C. doi : 10.1038/521015a . PMID  25951262.
16. "IP Group PLC – La empresa de cartera Oxford Nanopore anuncia una recaudación de fondos de 70 millones de libras – IP Group PLC". Archivado desde el original el 21 de noviembre de 2015 . Consultado el 20 de noviembre de 2015 .
17. Loman, Nicholas J; Watson, Mick (2015). "Lanzamiento exitoso de pruebas para secuenciación de nanoporos". Nature Methods . 12 (4): 303–304. doi :10.1038/nmeth.3327. ISSN  1548-7091. PMID  25825834. S2CID  5604121.
18. "Oxford Nanopore lanza el secuenciador de nanoporos GridIon X5 y detalla las mejoras del producto". GenomeWeb . Consultado el 6 de julio de 2017 .
19. "GridION X5". nanoporetech.com . Consultado el 6 de julio de 2017 .
20. "Comunidad - Oxford Nanopore Technologies". Archivado desde el original el 27 de junio de 2015 . Consultado el 17 de junio de 2015 .
21. "Especificaciones - Comunidad - Oxford Nanopore Technologies". Archivado desde el original el 1 de junio de 2016 . Consultado el 20 de noviembre de 2015 .
22. "Charla del director técnico de Oxford Nanopore, Clive Brown, en el London Calling: MinION ASIC, volTRAX, promethION". Next Gen Seek . 14 de mayo de 2015.
23. "VolTRAX". nanoporetech.com . Consultado el 17 de octubre de 2016 .
24. "Oxford Nanopore: queremos crear la Internet de los seres vivos". Wired UK .
25. "Metrichor". metrichor.com . Consultado el 17 de agosto de 2016 .
26. "SmidgION - Productos y servicios - Oxford Nanopore Technologies". www2.nanoporetech.com . Archivado desde el original el 23 de agosto de 2016 . Consultado el 17 de agosto de 2016 .
27. Check Hayden, Erika (2012). "El secuenciador de genomas Nanopore hace su debut". Nature . doi : 10.1038/nature.2012.10051 . ISSN  1744-7933.

Enlaces externos

• Sitio web de Oxford Nanopore Technologies