La temporada 1989-1990 de la Southern Football League fue la 87ª en la historia de la liga, una competición de fútbol inglesa.
Dover Athletic ganó la Premier Division, pero no ascendió debido a problemas de nivelación del terreno y el subcampeón Bath City ocupó un lugar en la Conferencia de Fútbol . Los cuatro últimos clubes descendieron a las divisiones Sur y Midland, mientras que los campeones y subcampeones de las divisiones inferiores obtienen un lugar para la próxima temporada de la Primera División. Banbury United , Hounslow , Sandwell Borough y Sheppey United abandonaron la liga.
La Premier Division estaba formada por 22 clubes, incluidos 17 clubes de la temporada anterior y cinco clubes nuevos:
La División Midland estaba formada por 22 clubes, incluidos 17 clubes de la temporada anterior y cinco clubes nuevos:
Además, al final de la temporada anterior, Forest Green Rovers pasó a llamarse Stroud y Ashfield Hightree pasó a llamarse Sandwell Borough .
La División Sur estaba formada por 22 clubes, incluidos 18 clubes de la temporada anterior y cuatro clubes nuevos:
Además, al final de la temporada anterior Thanet United volvió a llamarse Margate .