stringtranslate.com

Árbol de la vida abierto

El Árbol de la Vida Abierto es un árbol filogenético de la vida en línea , un esfuerzo colaborativo financiado por la National Science Foundation . [2] [3] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015. [4] El gráfico interactivo permite al usuario hacer zoom en las clasificaciones taxonómicas, los árboles filogenéticos y la información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se regresará a su fuente y taxonomía de referencia.

El árbol de la vida en el nodo Eukaryota

Acercarse

El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético (disponible en tree.opentreeoflife.org [5] ) a partir de una taxonomía integral y un conjunto seleccionado de estimaciones filogenéticas publicadas.

La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones grandes producidas por otros proyectos; se crea utilizando una herramienta de software llamada "smasher". [6] La taxonomía resultante se llama Open Tree Taxonomy (OTT) y se puede consultar en línea. [7]

Historia

El proyecto se inició en junio de 2012 con una subvención trienal de la NSF para investigadores de diez universidades. En 2015, se concedió una subvención complementaria de dos años a investigadores de tres instituciones.

Véase también

Referencias

  1. ^ "Licencia OpenTreeOfLife".
  2. ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, ​​Coghill LM, et al. (octubre de 2015). "Síntesis de filogenia y taxonomía en un árbol de la vida completo". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (41): 12764–9. Bibcode :2015PNAS..11212764H. doi : 10.1073/pnas.1423041112 . PMC 4611642 . PMID  26385966. 
  3. ^ "Montaje, visualización y análisis del árbol de la vida". National Science Foundation (NSF). 11 de marzo de 2011. Consultado el 11 de febrero de 2016 .
  4. ^ Pennisi E (21 de septiembre de 2015). "El primer árbol de la vida completo muestra cuán relacionado estás con millones de especies". Revista Science .
  5. ^ "opentree". Desarrolladores de Open Tree of Life.
  6. ^ Rees JA, Cranston K (2017). "Ensamblaje automatizado de una taxonomía de referencia para la síntesis de datos filogenéticos". Revista de datos de biodiversidad . 5 (5): e12581. doi : 10.3897/BDJ.5.e12581 . PMC 5515096 . PMID  28765728. 
  7. ^ "árbol.opentreeoflife.org".