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Nir Friedman

Nir Friedman (nacido en 1967) es un profesor israelí de informática y biología en la Universidad Hebrea de Jerusalén . [3] [4]

Su investigación combina el Aprendizaje Automático y el Aprendizaje Estadístico con la Biología de Sistemas , concretamente en los campos de la Regulación Génica , la Transcripción y la Cromatina .

Educación e investigación

Friedman obtuvo su licenciatura en Ciencias de la Universidad de Tel Aviv (1987) y su maestría en Ciencias del Instituto Weizmann de Ciencias (1992). [5] En 1997, completó su doctorado. en Stanford bajo la supervisión de Joseph Halpern , en el campo de la Inteligencia Artificial . [6]

Después de algún trabajo postdoctoral en la Universidad de California, Berkeley , aceptó un puesto docente en la Facultad de Ciencias de la Computación, [7] de la Universidad Hebrea de Jerusalén .

Su investigación muy citada [8] [9] incluye trabajos sobre clasificadores de redes bayesianos [10] (con Danny Geiger y Moises Goldszmidt), EM estructural bayesiano, [11] y el uso de métodos bayesianos para analizar datos de expresión génica [12] [ 13] [14] [15] (con Aviv Regev , Dana Pe'er , Eran Segal , Daphne Koller y David Botstein ). Los trabajos más recientes se centran en modelos gráficos probabilísticos , la reconstrucción de redes reguladoras , interacciones genéticas y el papel de la cromatina en la regulación transcripcional (con Oliver Rando) [16]

En 2009, Friedman y Koller publicaron un libro de texto sobre modelos gráficos probabilísticos . [17] Más tarde ese año, se unió al Instituto de Ciencias de la Vida, [18] y abrió un laboratorio experimental donde utiliza herramientas robóticas avanzadas para estudiar la regulación transcripcional en la levadura Saccharomyces cerevisiae . [19]

Referencias

  1. ^ "Nir Friedman - Yad Hanadiv". Yadhanadiv.org.il . Archivado desde el original el 25 de junio de 2016 . Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  2. ^ "El joven biólogo de HU gana el premio australiano". The Jerusalem Post-JPost.com . Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  3. ^ "Nir Friedman". Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  4. ^ "Laboratorio de Nir Friedman". Systemsbio.cs.huji.ac.il . Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  5. ^ "Curriculum Vitae: Nir Friedman" (PDF) . Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  6. ^ "Copia archivada". Archivado desde el original el 25 de abril de 2012 . Consultado el 22 de octubre de 2011 .{{cite web}}: Mantenimiento CS1: copia archivada como título ( enlace )
  7. ^ "La Escuela de Ingeniería y Ciencias de la Computación Rachel y Selim Benin". Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  8. ^ "nir Friedman - Google Académico". Scholar.google.com . Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  9. ^ Resultados de búsqueda del autor Friedman N en PubMed .
  10. ^ "Clasificadores de redes bayesianas". Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  11. ^ "El algoritmo EM estructural bayesiano". Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  12. ^ Friedman, N.; Linial, M.; Nachman, I.; Pe'er, D. (2000). "Uso de redes bayesianas para analizar datos de expresión". Revista de biología computacional . 7 (3–4): 601–620. CiteSeerX 10.1.1.191.139 . doi :10.1089/106652700750050961. PMID  11108481. 
  13. ^ Segal, E.; Shapira, M.; Regev, A.; Pe'er, D.; Botstein, D.; Koller, D.; Friedman, N. (2003). "Redes de módulos: identificación de módulos reguladores y sus reguladores específicos de condición a partir de datos de expresión genética". Genética de la Naturaleza . 34 (2): 166-176. doi :10.1038/ng1165. PMID  12740579. S2CID  6146032.
  14. ^ Friedman, N. (2004). "Inferir redes celulares mediante modelos gráficos probabilísticos". Ciencia . 303 (5659): 799–805. Código Bib : 2004 Ciencia... 303..799F. doi : 10.1126/ciencia.1094068. PMID  14764868. S2CID  6819971.
  15. ^ Segal, E.; Friedman, N.; Koller, D.; Regev, A. (2004). "Un mapa de módulos que muestra la actividad condicional de los módulos de expresión en el cáncer". Genética de la Naturaleza . 36 (10): 1090–1098. doi : 10.1038/ng1434 . PMC 2271138 . PMID  15448693. 
  16. ^ "Nir Friedman". Cs.huji.ac.il. ​Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  17. ^ Daphne Koller y Nir Friedman (2009). Modelos gráficos probabilísticos . Prensa del MIT. ISBN 978-0-262-01319-2.
  18. ^ "El Instituto de Ciencias de la Vida Alexander Silberman". Bio.huji.ac.il. ​Archivado desde el original el 26 de abril de 2016 . Consultado el 25 de mayo de 2016 .
  19. ^ "Instalación robótica". Systemsbio.cs.huji.ac.il . Consultado el 25 de mayo de 2016 .