El extremo N (también conocido como extremo amino , extremo NH2 , extremo N-terminal o extremo amina ) es el inicio de una proteína o polipéptido , en referencia al grupo amino libre ( -NH2 ) ubicado en el extremo de un polipéptido. Dentro de un péptido, el grupo amino está unido al grupo carboxílico de otro aminoácido, convirtiéndolo en una cadena. Eso deja un grupo carboxílico libre en un extremo del péptido, llamado extremo C , y un grupo amina libre en el otro extremo llamado extremo N. Por convención, las secuencias peptídicas se escriben del extremo N al extremo C , de izquierda a derecha (en los sistemas de escritura LTR ). [1] Esto correlaciona la dirección de traducción con la dirección del texto, porque cuando una proteína se traduce del ARN mensajero , se crea desde el extremo N al extremo C, a medida que se agregan aminoácidos al extremo carboxilo de la proteína.
Cada aminoácido tiene un grupo amino y un grupo carboxílico . Los aminoácidos se unen entre sí mediante enlaces peptídicos que se forman a través de una reacción de deshidratación que une el grupo carboxilo de un aminoácido al grupo amino del siguiente de cabeza a cola para formar una cadena polipeptídica . La cadena tiene dos extremos: un grupo amino, el extremo N, y un grupo carboxilo libre, el extremo C. [2]
Cuando una proteína se traduce a partir de ARN mensajero , se crea desde el extremo N al extremo C. El extremo amino de un aminoácido (en un ARNt cargado ) durante la etapa de elongación de la traducción, se une al extremo carboxilo de la cadena en crecimiento. Dado que el codón de inicio del código genético codifica el aminoácido metionina , la mayoría de las secuencias de proteínas comienzan con una metionina (o, en bacterias, mitocondrias y cloroplastos , la versión modificada N -formilmetionina , fMet). Sin embargo, algunas proteínas se modifican postraduccionalmente , por ejemplo, mediante escisión de un precursor proteico , y por lo tanto pueden tener diferentes aminoácidos en su extremo N-terminal.
El extremo N es la primera parte de la proteína que sale del ribosoma durante la biosíntesis de proteínas . A menudo contiene secuencias de péptidos señal , " códigos postales intracelulares " que dirigen la entrega de la proteína al orgánulo adecuado . El péptido señal normalmente se elimina en el destino mediante una peptidasa señal . El aminoácido N-terminal de una proteína es un determinante importante de su vida media (probabilidad de degradarse). Esto se llama regla del N-fin .
El péptido señal N-terminal es reconocido por la partícula de reconocimiento de señales (SRP) y da como resultado el direccionamiento de la proteína a la vía secretora . En las células eucariotas , estas proteínas se sintetizan en el retículo endoplásmico rugoso . En las células procarióticas , las proteínas se exportan a través de la membrana celular . En los cloroplastos , los péptidos señal dirigen las proteínas a los tilacoides .
El péptido de dirección mitocondrial N-terminal (mtTP) permite que la proteína se importe a la mitocondria .
El péptido dirigido al cloroplasto N-terminal (cpTP) permite que la proteína se importe al cloroplasto .
Los extremos N de la proteína se pueden modificar co - o postraduccionalmente. Las modificaciones incluyen la eliminación de la metionina iniciadora (iMet) mediante aminopeptidasas , la unión de pequeños grupos químicos como acetilo , propionilo y metilo , y la adición de anclajes de membrana, como los grupos palmitoilo y miristoilo [3].
La acetilación N-terminal es una forma de modificación de proteínas que puede ocurrir tanto en procariotas como en eucariotas . Se ha sugerido que la acetilación N-terminal puede impedir que una proteína siga una vía secretora . [4]
El extremo N puede modificarse mediante la adición de un ancla de miristoilo. Las proteínas modificadas de esta manera contienen un motivo de consenso en su extremo N como señal de modificación.
El extremo N también puede modificarse mediante la adición de un ancla de ácido graso para formar proteínas N-acetiladas. La forma más común de dicha modificación es la adición de un grupo palmitoílo.