El motivo JUMPstart RNA describe una estructura secundaria conservada basada en ARN asociada con elementos JUMPstart. [1] La secuencia JUMPstart de 39 pares de bases describe un elemento conservado aguas arriba de los genes que participan en la síntesis de polisacáridos . [2] Se ha demostrado que el elemento JUMPstart funciona como un ARN y está presente en las regiones 5' no traducidas de los genes que regula. [3]
Las secuencias JUMPstart incluyen un elemento ops, que es un acrónimo de "supresor de polaridad de operón" y tiene el consenso de nucleótidos GGCGGUAG. [4] El elemento ops actúa en conjunto con la proteína RfaH para mejorar la transcripción de genes aguas abajo del elemento ops, especialmente genes alejados dentro de operones largos . [3] [4] [5] [6]
Referencias
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J y col. (Marzo de 2010). "La genómica comparada revela 104 ARN estructurados candidatos de bacterias, arqueas y sus metagenomas". Genoma Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605.
- ^ Hobbs M, Reeves PR (junio de 1994). "La secuencia JUMPstart: un elemento de 39 pb común a varios grupos de genes de polisacáridos". Mol. Microbiol . 12 (5): 855–856. doi :10.1111/j.1365-2958.1994.tb01071.x. PMID 8052136. S2CID 19948539.
- ^ ab Marolda CL, Valvano MA (junio de 1998). "Región promotora del grupo de genes de lipopolisacáridos específicos de Escherichia coli O7: caracterización estructural y funcional de una secuencia de ARNm no traducida aguas arriba". J. Bacteriol . 180 (12): 3070–3079. doi :10.1128/JB.180.12.3070-3079.1998. PMC 107806 . PMID 9620955.
- ^ ab Nieto JM, Bailey MJ, Hughes C, Koronakis V (febrero de 1996). "Supresión de la polaridad de la transcripción en el operón de hemolisina de Escherichia coli mediante un elemento corto aguas arriba compartido por polisacáridos y determinantes de transferencia de ADN". Mol. Microbiol . 19 (4): 705–713. doi :10.1046/j.1365-2958.1996.446951.x. PMID 8820641. S2CID 39593320.
- ^ Leeds JA, Welch RA (junio de 1997). "Mejora de la transcripción a través del operón hemolisina de Escherichia coli, hlyCABD: RfaH y las secuencias de ADN JUMPStart aguas arriba funcionan juntas a través de un mecanismo de posiniciación". J. Bacteriol . 179 (11): 3519–3527. doi :10.1128/jb.179.11.3519-3527.1997. PMC 179143 . PMID 9171395.
- ^ Wang L, Jensen S, Hallman R, Reeves PR (agosto de 1998). "La expresión del grupo de genes del antígeno O está regulada por RfaH a través de la secuencia JUMPstart". Microbiol FEMS. Lett . 165 (1): 201–206. doi : 10.1111/j.1574-6968.1998.tb13147.x . PMID 9711858.
enlaces externos
- Página para JUMPstart RNA en Rfam
