ModBase es una base de datos de modelos comparativos de estructuras de proteínas anotados , que contiene modelos para más de 3,8 millones de secuencias de proteínas únicas. [1] Los modelos se crean mediante el proceso de modelado comparativo ModPipe, que se basa en el programa MODELLER .
ModBase se desarrolla en el laboratorio de Andrej Sali en la UCSF . También se puede acceder a los modelos ModBase a través del Portal de modelos de proteínas.
Ver también
Referencias
- ^ ab Pieper, Úrsula; Webb Benjamín M; Barkán David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrado C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjolander Kimmen; Ferrín Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (enero de 2011). "ModBase, una base de datos de modelos comparativos de estructuras de proteínas anotados y recursos asociados". Ácidos nucleicos Res . 39 (Problema de la base de datos). Inglaterra: D465-74. doi : 10.1093/nar/gkq1091. PMC 3013688 . PMID 21097780.
enlaces externos
- http://salilab.org/modbase
