El Ministerio de Asuntos Exteriores de Estonia ( en estonio : Eesti Vabariigi Välisministeerium ) es una agencia gubernamental a nivel de gabinete en Estonia encargada de conducir y diseñar la política exterior de Estonia .
El Ministerio de Asuntos Exteriores de Estonia se estableció en 1919, poco después de la declaración de independencia de Estonia el 23 de febrero de 1918. Tras la ocupación de Estonia por la Unión Soviética en septiembre de 1939 tras el Pacto Mólotov-Ribbentrop en agosto del mismo año. Tras el establecimiento del régimen soviético en Estonia, el cuerpo diplomático estonio permaneció en el exilio y, aunque finalmente se estableció un gobierno nacional en el exilio , el cuerpo diplomático en el exilio siguió siendo una institución separada durante la era de la Guerra Fría y las dos instituciones no se reconocieron mutuamente. Tanto los diplomáticos estonios como el gobierno en el exilio promovieron y exigieron la independencia de Estonia en el extranjero. Entre los ministros de Asuntos Exteriores de Estonia en el exilio se encontraban August Rei (1944-1945), Aleksander Warma (1953-1964), August Koern (1964-1982), Elmar Lipping (1982-1990) y Olev Olesk (1990-1992). Tras la restauración de la independencia de Estonia en 1990, el Ministerio de Asuntos Exteriores se restableció en Tallin.