La segunda temporada de la serie de televisión estadounidense de comedia Scrubs se estrenó en la cadena NBC el 26 de septiembre de 2002 y concluyó el 17 de abril de 2003. Consta de 22 episodios. Para la segunda temporada, Neil Flynn se convirtió en un personaje regular de la serie. Colin Hay apareció como estrella invitada por primera vez. También es la primera vez que un episodio le da la narración a otro personaje regular, en "His Story".
El programa utilizó una secuencia de créditos de apertura más larga para los episodios 1 y 2, recorriendo la sala en lugar de solo dos camas, incluida una toma de Flynn como El Conserje , mostrando los nombres de los personajes habituales de la serie y terminando con la radiografía de tórax que muestra el corazón en el lado izquierdo del pecho. Sin embargo, los créditos volvieron a la versión original en el episodio 3.
La segunda temporada se centra en el segundo año del Dr. John Dorian practicando medicina en Sacred Heart, donde ahora es residente. En el primer episodio de la temporada, todos siguen en estado de shock por los secretos que Jordan acaba de revelar ("My Last Day"). A medida que avanza la temporada, el hermano mayor de JD, Dan ( Tom Cavanagh ), viene de visita, los problemas de dinero afectan a JD, Elliot y Turk, Turk le propone matrimonio a Carla y Elliot encuentra un nuevo novio, un enfermero llamado Paul Flowers ( Rick Schroder ). El Dr. Cox reanuda una relación sexual con su ex esposa Jordan, con resultados bastante inesperados.
Tim Hobert fue agregado como productor consultor. Angela Nissel fue contratada como escritora para esta temporada. April Pesa, la coordinadora de guiones, tuvo la oportunidad de escribir un episodio. Bonnie Sikotwiz (acreditada como Bonnine Schneider) y Hadley Davis, a quien Lawrence conocía a través de Spin City , vinieron a escribir un episodio esta temporada.