Metanosarcinales

Orden de arqueas metanogénicas

Methanosarcinales es un orden de Archaea en la clase Methanomicrobia , filo Methanobacteriota . ^[1] El orden Methanosarcinales contiene linajes metanogénicos y metanotróficos , aunque estos últimos hasta ahora no tienen representantes de cultivo puro. ^[2] Los linajes metanotróficos del orden Methanosarcinales se abreviaron inicialmente como ANME (anaerobic methanotrophs ) para distinguirlos de las bacterias metanotróficas aeróbicas. Actualmente, esos linajes reciben sus propios nombres como Ca. Methanoperedens, Ca. Methanocomedens (ANME-2a), Ca.Methanomarinus (ANME-2b), Ca. Methanogaster (ANME-2c), Ca. Methanovorans (ANME-3). ^[3] El orden contiene arqueona con uno de los genomas más grandes, Methanosarcina acetivorans C2A, tamaño del genoma 5,75 Mbp. ^[4]

Los organismos ubicados dentro del orden se pueden encontrar en agua dulce, salada, sedimentos ricos en sal, digestores anaeróbicos y sistemas digestivos de animales. El orden consiste en especies mesófilas o moderadamente termófilas, neutrófilas o alcalófilas, algunas capaces de crecer en altas concentraciones de sal (géneros Methanohalobium , Methanohalophilus y Methanosalsum ). ^{[5] [6]} La mayoría de las especies del orden fueron aisladas o detectadas en sedimentos marinos y de agua dulce, suelo con solo unos pocos linajes especializados adaptados al tracto digestivo de los animales: géneros Methanimicrococcus , Methanolapillus y Ca. Methanofrustulum que se pueden encontrar en termitas/cucarachas, milpiés y rumiantes, respectivamente. ^{[7] [8]}

La mayoría de las células tienen paredes celulares que carecen de peptidoglicano y pseudomureína con una notable presencia de metanocondroitina en el género Methanosarcina . ^[9] Como todos los demás metanógenos, los representantes de Methanosarcinales son estrictamente anaeróbicos y utilizan la vía de la metanogénesis como la única vía para la producción de ATP . Sin embargo, además de los sustratos comunes entre otros metanógenos H ₂ /CO ₂ , Methanosarcinales se caracteriza por la capacidad de utilizar acetato (metanogénesis acetilástica), compuestos metilados como metanol o metilaminas (metanogénesis metilotrófica), o incluso compuestos aromáticos metoxilados (metanogénesis metoxidotrófica). ^{[10] [11]}

Filogenia

El orden Methanosarcinales contiene las siguientes familias (géneros que comprenden cada familia enumerada a continuación de la familia correspondiente):

MetanosarcináceasBalch y Wolfe 1981

Metanimicrococcus corrig. Sprenger et al. 2000

Methanococcoides Sowers y Ferry 1985

Metanohalobium Zhilina y Zavarzin 1988

Metanohalophilus Paterek y Smith 1988

Metanolobus König y Stetter 1983

Metanometilovorans Lomans et al. 2004

Methanosalsum Boone y Baker 2002

Metanosarcina Kluyver y van Niel 1936

MetanotrichaceaeAkinyemiy otros.2021

Metanotrix Huser y otros 1983

MethermicoccaceaeChengy otros.2007

Methermicoccus Cheng et al. 2007

Véase también

• Lista de géneros de Archaea

Referencias

1. "Orden: Methanosarcinales". lpsn.dsmz.de . Consultado el 7 de septiembre de 2024 .
2. Chadwick, Grayson L.; Skennerton, Connor T.; Laso-Pérez, Rafael; Leu, Andy O.; Speth, Daan R.; Yu, Hang; Morgan-Lang, Connor; Hatzenpichler, Roland; Goudeau, Danielle; Malmstrom, Rex; Brazelton, William J.; Woyke, Tanja; Hallam, Steven J.; Tyson, Gene W.; Wegener, Gunter (5 de enero de 2022). "La genómica comparativa revela la transferencia de electrones y los mecanismos sintróficos que diferencian arqueas metanotróficas y metanogénicas". PLOS Biology . 20 (1): e3001508. doi : 10.1371/journal.pbio.3001508 . ISSN  1545-7885. PMC 9012536 . Número de modelo:  PMID34986141. 
3. Wegener, Gunter; Laso-Pérez, Rafael; Orphan, Victoria J.; Boetius, Antje (8 de septiembre de 2022). "Degradación anaeróbica de alcanos por arqueas marinas". Revisión anual de microbiología . 76 (1): 553–577. doi :10.1146/annurev-micro-111021-045911. hdl : 10261/351814 . ISSN  0066-4227.
4. Saini, Jasleen; Deere, Thomas M.; Chanderban, Melissa; McIntosh, Gary J.; Lessner, Daniel J. (marzo de 2023). "Methanosarcina acetivorans". Tendencias en microbiología . 31 (3): 320–321. doi :10.1016/j.tim.2022.10.001. PMID  36280520.
5. Oren, Aharon (8 de agosto de 2014). "Taxonomía de las arqueas halófilas: estado actual y desafíos futuros". Extremófilos . 18 (5): 825–834. doi :10.1007/s00792-014-0654-9. ISSN  1431-0651. PMID  25102811.
6. Oren, Aharon (2014), "La familia Methanosarcinaceae", The Prokaryotes , Berlín, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, págs. 259-281, doi :10.1007/978-3-642-38954-2_408, ISBN 978-3-642-38953-5, consultado el 7 de septiembre de 2024
7. Protasov, Evgenii; Reeh, Hanna; Liu, Pengfei; Poehlein, Anja; Platt, Katja; Heimerl, Thomas; Hervé, Vincent; Daniel, Rolf; Brune, Andreas (6 de agosto de 2024). "Reducción del genoma en nuevos Methanosarcinales obligados a reducir el metilo aislados de los intestinos de los artrópodos (Methanolapillus gen. nov. y Methanimicrococcus)". FEMS Microbiology Ecology . 100 (9). doi :10.1093/femsec/fiae111. ISSN  1574-6941. PMC 11362671 . PMID  39108084. 
8. Thomas, Courtney M.; Desmond-Le Quéméner, Elie; Gribaldo, Simonetta; Borrel, Guillaume (10 de junio de 2022). "Factores que configuran la abundancia y diversidad del arqueoma intestinal en todo el reino animal". Nature Communications . 13 (1): 3358. Bibcode :2022NatCo..13.3358T. doi :10.1038/s41467-022-31038-4. ISSN  2041-1723. PMC 9187648 . PMID  35688919. 
9. Klingl, Andreas (25 de noviembre de 2014). "Capa S y membrana citoplasmática: excepciones de la pared celular arqueal típica con un enfoque en las membranas dobles". Frontiers in Microbiology . 5 : 624. doi : 10.3389/fmicb.2014.00624 . ISSN  1664-302X. PMC 4243693 . PMID  25505452. 
10. Mand, Thomas D.; Metcalf, William W. (2019-11-20). "Conservación de energía y función de la hidrogenasa en arqueas metanogénicas, en particular el género Methanosarcina". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 83 (4). doi :10.1128/mmbr.00020-19. ISSN  1092-2172. PMC 6759668 . PMID  31533962. 
11. Kurth, Julia M.; Op den Camp, Huub JM; Welte, Cornelia U. (15 de junio de 2020). "Varias formas de lograr un objetivo: metanogénesis a partir de sustratos no convencionales". Applied Microbiology and Biotechnology . 104 (16): 6839–6854. doi :10.1007/s00253-020-10724-7. ISSN  0175-7598. PMC 7374477 . PMID  32542472. 
12. "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
13. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
14. "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
15. "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
16. "ar53_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
17. "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .

Lectura adicional

Revistas científicas

• Cavalier-Smith, T (2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana". Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID  11837318.
• Cavalier-Smith, T (1986). "Los reinos de los organismos". Nature . 324 (6096): 416–417. Bibcode :1986Natur.324..416C. doi :10.1038/324416a0. PMID  2431320. S2CID  5242667.

Libros científicos

• Boone DR; Whitman WB; Koga Y (2001). «Orden III. Methanosarcinales ord. nov.». En República Dominicana Boone; RW Castenholz (eds.). Manual de bacteriología sistemática de Bergey Volumen 1: Las arqueas y las bacterias fototróficas y profundamente ramificadas (2ª ed.). Nueva York: Springer Verlag . págs.169. ISBN 978-0-387-98771-2.
• Grant WD; Kamekura M; McGenity TJ; Ventosa A (2001). "Clase III. Clase Halobacteria. nov." En DR Boone; RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deep branching and phototrophic Bacteria (2.ª ed.). Nueva York: Springer Verlag. págs. 169. ISBN. 978-0-387-98771-2.
• Garrity GM; Bell JA; Lilburn TG (2004). "Esquema taxonómico de los procariotas". Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, versión 4.0 (2.ª ed.). Nueva York: Springer Verlag. doi :10.1007/bergeysoutline200310 (inactivo el 1 de noviembre de 2024).{{cite book}}: CS1 maint: DOI inactivo a partir de noviembre de 2024 ( enlace )Versión 5.0.

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