Egipto tiene esencialmente un clima desértico cálido ( clasificación climática de Köppen BWh ). El clima es generalmente extremadamente seco en todo el país, excepto en la costa norte del Mediterráneo , donde llueve en invierno. Además de la escasez de lluvias, el calor extremo durante los meses de verano también es una característica climática general de Egipto, aunque las temperaturas diurnas son más moderadas a lo largo de la costa norte .
El viento predominante del noroeste procedente del mar Mediterráneo sopla continuamente sobre la costa norte sin la interposición de una eventual cadena montañosa y, por tanto, modera mucho las temperaturas durante todo el año. Debido al efecto, las temperaturas mínimas promedio varían de 9,5 °C (49,1 °F) en invierno a 23 °C (73,4 °F) en verano y las temperaturas máximas promedio varían de 17 °C (62,6 °F) en invierno a 32 ° C (89,6 °F) en verano. Aunque las temperaturas se moderan en las costas, la situación cambia en el interior, alejado de los vientos moderados del norte. Así, en el centro y el sur las temperaturas nocturnas son muy calurosas, especialmente en verano cuando las temperaturas máximas medias pueden superar los 40 °C, como en Asuán , Luxor , Asyut o Sohag que se encuentran en los desiertos de Egipto.
Cada año, entre marzo y mayo, sopla un viento extremadamente cálido, seco y polvoriento del sur o suroeste. Este viento se llama khamasīn . Cuando el flujo de aire seco sopla continuamente sobre vastas regiones desérticas, levanta finas partículas de arena y polvo y finalmente da como resultado un viento polvoriento que generalmente se siente en la periferia del desierto. Cuando este viento sopla sobre Egipto, provoca que las altas temperaturas se eleven temporalmente a niveles peligrosos, generalmente por encima de los 45 °C (113 °F), y que los niveles de humedad relativa caigan por debajo del 5%. El khamasīn provoca olas de calor tempranas y repentinas y los récords absolutos de temperatura más altas en Egipto.
Egipto recibe entre 20 mm (0,79 pulgadas) y 200 mm (7,87 pulgadas) de precipitación promedio anual a lo largo de la estrecha costa mediterránea , pero al sur de El Cairo, el promedio cae a casi 0 milímetros (0,00 pulgadas) en la parte central y sur de el país. Los lugares más nublados y lluviosos se encuentran en Alejandría y Rafah y sus alrededores . La duración del sol es alta en todo Egipto, oscilando desde un mínimo de 3.300 horas en la parte más septentrional en lugares como Alejandría hasta un máximo de más de 4.000 horas más en el interior, en la mayor parte del país.
Algunos lugares montañosos del Sinaí , como Santa Catalina , tienen temperaturas nocturnas más frescas debido a su gran elevación. Suele nieva en las montañas del Sinaí, pero casi nunca nieva en las ciudades de Giza, El Cairo y Alejandría. Por ejemplo, en diciembre de 2013, El Cairo recibió una sola nevada durante la noche por primera vez desde 1901.