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MeRIPseq

MeRIPseq [1] (o MeRIP-seq ) significa secuenciación por inmunoprecipitación de ARN metilado , un método para la detección de modificaciones postranscripcionales del ARN desarrollado por Kate Meyer et al. mientras trabajaban en el laboratorio de Sammie Jaffrey en la Facultad de Ciencias Médicas de la Universidad de Cornell. También se denomina m6A-seq. [2]

Benjamin Delatte y sus colegas acuñaron en 2016 una variación del método MerIP-seq. Esta variante, llamada hMerIP-seq (inmunoprecipitación de ARN con hidroximetilcitosina), utiliza un anticuerpo que reconoce específicamente la 5-hidroximetilcitosina, una base de ARN modificada que afecta la traducción in vitro y el desarrollo cerebral en Drosophila. [3]

Referencias

  1. ^ Meyer, Kate D.; Saletore, Yogesh; Zumbo, Paul; Elemento, Olivier; Mason, Christopher E.; Jaffrey, Samie R. (31 de mayo de 2012). "Análisis exhaustivo de la metilación del ARNm revela enriquecimiento en UTR 3' y cerca de codones de terminación". Cell . 149 (7): 1635–1646. doi :10.1016/j.cell.2012.05.003. PMC  3383396 . PMID  22608085.
  2. ^ Dominissini, Dan; Moshitch-Moshkovitz, Sharon; Schwartz, Schraga; Salmon-Divon, Malí; Ungar, Lior; Osenberg, Sivan; Cesarkas, Karen; Jacob-Hirsch, Jasmine; Amariglio, Ninette; Kupiec, Martín; Sorek, Rotem; Rechavi, Gideon (28 de abril de 2012). "Topología de los metilomas de ARN m6A humano y de ratón revelados por m6A-seq". Naturaleza . 485 (7397): 201–206. Código Bib :2012Natur.485..201D. doi : 10.1038/naturaleza11112. PMID  22575960. S2CID  3517716.
  3. ^ Delatte, Benjamin (2016). "Distribución y función de la hidroximetilcitosina del ARN en todo el transcriptoma". Science . 351 (6270): 282–285. Bibcode :2016Sci...351..282D. doi : 10.1126/science.aac5253 . PMID  26816380.