Se suponía que Margarita se convertiría en la tercera esposa de Felipe II de Francia . [4] Sin embargo, cuando su padre la escoltaba a Francia en mayo de 1195, Tomás I de Saboya se la llevó. [5] Atraído por su belleza, el conde Tomás se casó con ella, [6] alegando que Felipe II ya estaba casado (el rey francés se había casado con Ingeborg de Dinamarca en 1193, pero la había repudiado poco después). El padre de Margarita enfermó y murió después de la boda, y su madre murió al año siguiente.