Un mapa de biositios es una forma en que una institución u organización de investigación biomédica puede mostrar cómo se distribuye la información biológica a través de sus sistemas y redes de tecnología de la información . Esta información puede compartirse con otras organizaciones e investigadores.
El Biositemap permite a los navegadores web , rastreadores y robots acceder y procesar fácilmente la información para usarla en otros sistemas, medios y formatos computacionales. Los protocolos de Biositemaps proporcionan pistas para los recolectores web de Biositemap , lo que les permite encontrar recursos y contenido en toda la interconexión del sistema Biositemap. Esto significa que los usuarios humanos o máquinas pueden acceder a cualquier información relevante sobre cualquier tema en todas las organizaciones a través del sistema Biositemap y llevarla a sus propios sistemas para asimilarla o analizarla.
La información se almacena normalmente en un archivo biositemap.rdf o biositemap.xml que contiene listas de información sobre los datos, el software, las herramientas, el material y los servicios que proporciona o posee esa organización. La información se presenta en metacampos y se puede crear en línea a través de sitios como el editor en línea de biositemaps. [1]
La información es una combinación de mapas de sitios y fuentes RSS y se crea utilizando el modelo de información (IM) y la ontología de recursos biomédicos (BRO). El IM es responsable de definir los datos almacenados en los metacampos y la BRO controla la terminología de los datos almacenados en el campo resource_type. La BRO es fundamental para facilitar la interactividad de otras organizaciones y terceros para buscar y refinar esas búsquedas.
El Protocolo Biositemaps [2] permite a los científicos, ingenieros, centros e instituciones dedicados al modelado, desarrollo de herramientas de software y análisis de datos biomédicos e informáticos transmitir y diseminar al mundo la información sobre sus últimos recursos de biología computacional (datos, herramientas de software y servicios web). El concepto de biositemap se basa en ideas de Efficient, Automated Web Resource Harvesting [3] y Crawler-friendly Web Servers [4] e integra las características de los mapas de sitio y los feeds RSS en un mecanismo descentralizado para que los biólogos computacionales y los bioinformáticos transmitan y recuperen abiertamente metadatos sobre recursos biomédicos.
Estas descripciones de biositemaps específicas de sitios, instituciones o investigadores se publican en formato RDF en línea y son buscadas, analizadas, monitoreadas e interpretadas por motores de búsqueda web, aplicaciones web específicas para biositemaps y ontologías y otras aplicaciones interesadas en descubrir recursos actualizados o novedosos para investigaciones bioinformáticas y biomédicas. El mecanismo de biositemaps separa a los proveedores de recursos biomédicos (investigadores o instituciones) de los consumidores de contenido de recursos (investigadores, médicos, medios de comunicación, agencias de financiación, iniciativas educativas y de investigación).
Un Biositemap es un archivo RDF que enumera los recursos biomédicos y bioinformáticos de un grupo de investigación o consorcio específico. Permite a los desarrolladores de recursos biomédicos describir la funcionalidad y la facilidad de uso de cada una de sus herramientas de software, bases de datos o servicios web. [2] [5]
Los mapas de sitios biomédicos complementan y no reemplazan los marcos existentes para la difusión de datos, herramientas y servicios. El uso de un mapa de sitios biomédicos no garantiza que los recursos se incluyan en los índices de búsqueda ni influye en la forma en que la comunidad clasifica o percibe las herramientas. Lo que hará el protocolo de mapas de sitios biomédicos es proporcionar pistas, información y directrices a todos los recolectores web de mapas de sitios biomédicos que indiquen la existencia y el contenido de recursos biomédicos en diferentes sitios.
El protocolo Biositemap se basa en un modelo de información extensible que incluye propiedades específicas [6] que se utilizan comúnmente y son necesarias para caracterizar los recursos biomédicos:
La documentación actualizada sobre el modelo de información está disponible en el sitio web Biositemaps.