Familia de proteínas
La caja MADS es un motivo de secuencia conservado . Los genes que contienen este motivo se denominan familia de genes de la caja MADS. [1] La caja MADS codifica el dominio MADS de unión al ADN. El dominio MADS se une a secuencias de ADN de alta similitud con el motivo CC[A/T] 6 GG denominado caja CArG. [2] Las proteínas del dominio MADS son generalmente factores de transcripción . [2] [3] La longitud de la caja MADS informada por varios investigadores varía un poco, pero las longitudes típicas están en el rango de 168 a 180 pares de bases, es decir, el dominio MADS codificado tiene una longitud de 56 a 60 aminoácidos. [4] [5] [6] [7] Existe evidencia de que el dominio MADS evolucionó a partir de un tramo de secuencia de una topoisomerasa tipo II en un ancestro común de todos los eucariotas existentes. [8]
Origen del nombre e historia de la investigación
El primer gen MADS-box que se identificó fue el ARG80 de la levadura en ciernes, Saccharomyces cerevisiae [9] , pero en ese momento no se lo reconoció como miembro de una gran familia de genes. La familia de genes MADS-box recibió su nombre más tarde como un acrónimo que hace referencia a los cuatro miembros fundadores, [1] ignorando el ARG80 :
En A. thaliana , A. majus y Zea mays , este motivo está involucrado en el desarrollo floral. Los primeros estudios en estas angiospermas modelo marcaron el comienzo de la investigación sobre la evolución molecular de la estructura floral en general, así como su papel en las plantas sin flores. [11]
Diversidad
Se detectaron genes MADS-box en casi todos los eucariotas estudiados. [8] Mientras que los genomas de animales y hongos generalmente poseen solo alrededor de uno a cinco genes MADS-box, los genomas de plantas con flores tienen alrededor de 100 genes MADS-box. [12] [13]
Se distinguen dos tipos de proteínas de dominio MADS: las proteínas de dominio MADS tipo I o similares a SRF y las proteínas de dominio MADS tipo II o similares a MEF2 (después de MYOCYTE-ENHANCER-FACTOR2 ). [8] [13] Las proteínas de dominio MADS tipo SRF en animales y hongos tienen un segundo dominio conservado, el dominio SAM (SRF, ARG80, MCM1). [14] Las proteínas de dominio MADS tipo MEF2 en animales y hongos tienen el dominio MEF2 como un segundo dominio conservado. [14] En las plantas, las proteínas de dominio MADS similares a MEF2 también se denominan proteínas de tipo MIKC en referencia a su estructura de dominio conservada, donde el dominio MADS (M) es seguido por un dominio intermedio (I), uno similar a la queratina (K) y un dominio C-terminal . [12] En las plantas, las proteínas de dominio MADS forman tetrámeros y se cree que esto es central para su función. [15] [16] Se resolvió la estructura del dominio de tetramerización de la proteína de dominio MADS SEPALLATA3, lo que ilustra la base estructural para la formación de tetrámeros [17]
Un genetista que investiga intensamente los genes MADS-box es Günter Theißen, de la Universidad de Jena . Por ejemplo, él y sus colaboradores han utilizado estos genes para demostrar que el orden Gnetales está más estrechamente relacionado con las coníferas que con las plantas con flores . [18]
A partir de 2021, la MADS-box ha sido poco estudiada en el trigo [actualizar]. [19]
En Zea mays, el mutante Tunicate1 produce maíz en mazorcas . Tunicate1 es un mutante de Z. mays MADS19 ( ZMM19 ), en la familia de genes de FASE VEGETATIVA CORTA . ZMM19 puede expresarse ectópicamente . [19]
Esta expresión ectópica de ZMM19 en A. thaliana agranda los sépalos , lo que sugiere conservación . [19]
Función de los genes MADS-box
Los genes MADS-box tienen diversas funciones. En los animales, los genes MADS-box están involucrados en el desarrollo muscular y la proliferación y diferenciación celular . [14] Las funciones en los hongos varían desde la respuesta a las feromonas hasta el metabolismo de la arginina . [14]
En las plantas, los genes MADS-box están involucrados en el control de todos los aspectos principales del desarrollo, incluido el desarrollo del gametofito masculino y femenino , el desarrollo del embrión y la semilla, así como el desarrollo de raíces, flores y frutos. [12] [13]
Algunos genes MADS-box de plantas con flores tienen funciones homeóticas como los genes HOX de los animales. [1] Los genes MADS-box homeóticos florales (como AGAMOUS y DEFICIENS ) participan en la determinación de la identidad de los órganos florales según el modelo ABC de desarrollo floral . [20]
Otra función de los genes MADS-box es la determinación del tiempo de floración. En Arabidopsis thaliana, se ha demostrado que los genes MADS-box SOC1 [21] y Flowering Locus C [22] ( FLC ) tienen un papel importante en la integración de las vías moleculares del tiempo de floración. Estos genes son esenciales para el momento correcto de la floración y ayudan a garantizar que la fertilización se produzca en el momento del máximo potencial reproductivo.
Estructura de las proteínas MADS-box
La estructura de la proteína MADS box se caracteriza por cuatro dominios. En el extremo N-terminal se encuentra el dominio de unión al ADN MADS altamente conservado . [23] Junto al dominio MADS se encuentran los dominios Intervening (I) y Keratin -like (K) moderadamente conservados, que están involucrados en interacciones proteína-proteína específicas . [23] El dominio carboxilo-terminal (C) es altamente variable y está involucrado en la activación transcripcional y el ensamblaje de heterodímeros y complejos proteicos multiméricos . [24]
Referencias
- ^ abc Schwarz-Sommer Z, Huijser P, Nacken W, Saedler H, Sommer H (noviembre de 1990). "Control genético del desarrollo de las flores mediante genes homeóticos en Antirrhinum majus". Science . 250 (4983): 931–6. Bibcode :1990Sci...250..931S. doi :10.1126/science.250.4983.931. PMID 17746916. S2CID 15848590.
- ^ ab West AG, Shore P, Sharrocks AD (mayo de 1997). "Unión al ADN por factores de transcripción MADS-box: un mecanismo molecular para la flexión diferencial del ADN". Biología molecular y celular . 17 (5): 2876–87. doi :10.1128/MCB.17.5.2876. PMC 232140 . PMID 9111360.
- ^ Svensson M (2000). Evolución de una familia de genes vegetales con funciones reguladoras en el desarrollo; estudios sobre Picea abies y Lycopodium annotinum (PDF) . Tesis doctoral. Universidad de Uppsala, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biología, Departamento de Biología Evolutiva. ISBN 978-91-554-4826-4. Consultado el 30 de julio de 2007 .
- ^ Ma K, Chan JK, Zhu G, Wu Z (mayo de 2005). "La acetilación del factor potenciador de miocitos 2 por p300 mejora su actividad de unión al ADN, su actividad transcripcional y su diferenciación miogénica". Biología molecular y celular . 25 (9): 3575–82. doi :10.1128/MCB.25.9.3575-3582.2005. PMC 1084296 . PMID 15831463.
- ^ Lamb RS, Irish VF (mayo de 2003). "Divergencia funcional dentro de los linajes de genes homeóticos florales APETALA3/PISTILLATA". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (11): 6558–63. Bibcode :2003PNAS..100.6558L. doi : 10.1073/pnas.0631708100 . PMC 164485 . PMID 12746493.
- ^ Nam J, dePamphilis CW, Ma H, Nei M (septiembre de 2003). "Antigüedad y evolución de la familia de genes MADS-box que controlan el desarrollo de las flores en las plantas". Biología molecular y evolución . 20 (9): 1435–47. doi : 10.1093/molbev/msg152 . PMID 12777513.
- ^ Lü S, Du X, Lu W, Chong K, Meng Z (2007). "Dos genes MADS-box similares a AGAMOUS de Taihangia rupestris (Rosaceae) revelan trayectorias independientes en la evolución de las funciones homeóticas florales de clase C y clase D". Evolución y desarrollo . 9 (1): 92–104. doi :10.1111/j.1525-142X.2006.00140.x. PMID 17227369. S2CID 9253584.
- ^ abc Gramzow L, Ritz MS, Theissen G (abril de 2010). "Sobre el origen de los factores de transcripción del dominio MADS". Tendencias en genética . 26 (4): 149–53. doi :10.1016/j.tig.2010.01.004. PMID 20219261.
- ^ Dubois E, Bercy J, Descamps F, Messenguy F (1987). "Caracterización de dos nuevos genes esenciales para el crecimiento vegetativo en Saccharomyces cerevisiae: determinación de la secuencia de nucleótidos y mapeo cromosómico". Gene . 55 (2–3): 265–275. doi :10.1016/0378-1119(87)90286-1. PMID 3311883.
- ^ Sommer H, Beltrán JP, Huijser P, Pape H, Lönnig WE, Saedler H, Schwarz-Sommer Z (marzo de 1990). "Deficiens, un gen homeótico implicado en el control de la morfogénesis floral en Antirrhinum majus: la proteína muestra homología con factores de transcripción". The EMBO Journal . 9 (3): 605–13. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08152.x. PMC 551713 . PMID 1968830.
- ^ Friedman, William E.; Moore, Richard C.; Purugganan, Michael D. (2004). "La evolución del desarrollo vegetal". Revista americana de botánica . 91 (10). Sociedad Botánica de América ( Wiley ): 1726-1741. doi :10.3732/ajb.91.10.1726. ISSN 0002-9122. PMID 21652320.
- ^ abc Becker A, Theissen G (diciembre de 2003). "Los principales clados de genes MADS-box y su papel en el desarrollo y evolución de las plantas con flores". Filogenética molecular y evolución . 29 (3): 464–89. doi :10.1016/S1055-7903(03)00207-0. PMID 14615187.
- ^ abc Gramzow L, Theissen G (2010). "Guía del autoestopista para el mundo MADS de las plantas". Genome Biology . 11 (6): 214. doi : 10.1186/gb-2010-11-6-214 . PMC 2911102 . PMID 20587009.
- ^ abcd Shore P, Sharrocks AD (abril de 1995). "La familia de factores de transcripción MADS-box". Revista Europea de Bioquímica . 229 (1): 1–13. doi :10.1111/j.1432-1033.1995.0001l.x. PMID 7744019.
- ^ Theissen G, Saedler H (enero de 2001). "Biología vegetal. Cuartetos florales". Naturaleza . 409 (6819): 469–71. Código Bib :2001Natur.409..469T. doi : 10.1038/35054172 . PMID 11206529. S2CID 5325496.
- ^ Smaczniak C, Immink RG, Muiño JM, Blanvillain R, Busscher M, Busscher-Lange J, Dinh QD, Liu S, Westphal AH, Boeren S, Parcy F, Xu L, Carles CC, Angenent GC, Kaufmann K (enero de 2012). "Caracterización de complejos de factores de transcripción del dominio MADS en el desarrollo de flores de Arabidopsis". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 109 (5): 1560–5. Bibcode :2012PNAS..109.1560S. doi : 10.1073/pnas.1112871109 . PMC 3277181 . PMID 22238427.
- ^ Puranik S, Acajjaoui S, Conn S, Costa L, Conn V, Vial A, Marcellin R, Melzer R, Brown E, Hart D, Theißen G, Silva CS, Parcy F, Dumas R, Nanao M, Zubieta C (septiembre) 2014). "Base estructural para la oligomerización del factor de transcripción del dominio MADS SEPALLATA3 en Arabidopsis". La célula vegetal . 26 (9): 3603–15. doi :10.1105/tpc.114.127910. PMC 4213154 . PMID 25228343.
- ^ Winter KU, Becker A, Münster T, Kim JT, Saedler H, Theissen G (junio de 1999). "Los genes MADS-box revelan que las gnetofitas están más estrechamente relacionadas con las coníferas que con las plantas con flores". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (13): 7342–7. Bibcode :1999PNAS...96.7342W. doi : 10.1073/pnas.96.13.7342 . PMC 22087 . PMID 10377416.
- ^ abc Adamski, Nikolai M; Simmonds, James (ORCID); Brinton, Jemima F (ORCID); Backhaus, Anna E (ORCID); Chen, Yi (ORCID); Smedley, Mark (ORCID); Hayta, Sadiye (ORCID); Florio, Tobin (ORCID); Crane, Pamela (ORCID); Scott, Peter (ORCID); Pieri, Alice (ORCID); Hall, Olyvia (ORCID); Barclay, J Elaine; Clayton, Myles (ORCID); Doonan, John H (ORCID); Nibau, Candida (ORCID); Uauy, Cristobal (ORCID) (2021-05-01). "La expresión ectópica de Triticum polonicum VRT-A2 subyace a las glumas y granos alargados en el trigo hexaploide de una manera dependiente de la dosis". The Plant Cell . 33 (7). Sociedad Estadounidense de Biólogos de Plantas ( OUP ): 2296–2319. doi : 10.1093/plcell/koab119 . ISSN 1532-298X. PMC 8364232 . PMID 34009390. Mantenimiento de CS1: nombres numéricos: lista de autores ( enlace )
- ^ Coen ES, Meyerowitz EM (septiembre de 1991). "La guerra de los verticilos: interacciones genéticas que controlan el desarrollo de las flores". Nature . 353 (6339): 31–7. Bibcode :1991Natur.353...31C. doi :10.1038/353031a0. PMID 1715520. S2CID 4276098.
- ^ Onouchi H, Igeño MI, Périlleux C, Graves K, Coupland G (junio de 2000). "La mutagénesis de plantas que sobreexpresan CONSTANS demuestra nuevas interacciones entre los genes del tiempo de floración de Arabidopsis". The Plant Cell . 12 (6): 885–900. doi :10.1105/tpc.12.6.885. PMC 149091 . PMID 10852935.
- ^ Michaels SD, Amasino RM (mayo de 1999). "FLOWERING LOCUS C codifica una nueva proteína de dominio MADS que actúa como represor de la floración". The Plant Cell . 11 (5): 949–56. doi :10.1105/tpc.11.5.949. PMC 144226 . PMID 10330478.
- ^ ab Jack, Thomas (2004). "Mecanismos moleculares y genéticos del control floral". The Plant Cell . 16 Suppl (Suppl): S1–S17. doi :10.1105/tpc.017038. ISSN 1040-4651. PMC 2643400 . PMID 15020744.
- ^ Riechmann, Jose Luis; Meyerowitz, Elliot M. (1997). "Proteínas del dominio MADS en el desarrollo de plantas". Química biológica . 378 (10): 1079–1101. ISSN 1431-6730. PMID 9372178.
Enlaces externos
- Familia MADS de tipo M en PlantTFDB: base de datos de factores de transcripción de plantas
- Familia MADS de tipo MIKC en PlantTFDB: base de datos de factores de transcripción de plantas