Bernd Moeller (19 de mayo de 1931 - 29 de octubre de 2020) fue un teólogo e historiador de la iglesia protestante alemán .
Bernd Moeller estudió teología protestante además de historia. En 1956 se doctoró en el departamento de teología protestante de la Universidad de Mainz con la disertación Die Anfechtung bei Johann Tauler (Los escrúpulos religiosos en la obra de Johann Tauler). Dos años más tarde, siguió su habilitación sobre Johannes Zwick und die Reformation en Konstanz (John Zwick y la Reforma en Constanza) en la Universidad de Heidelberg . En 1964 sucedió a Ernst Wolf como catedrático de Historia de la Iglesia con énfasis en Historia de la Reforma en la Universidad de Göttingen , donde enseñó hasta su jubilación en 1999. A su vez, le sucedió Thomas Kaufmann.
Moeller es especialista en historia general de la iglesia y en historia urbana de finales de la Edad Media y de la época de la Reforma . Fue presidente de la Sociedad para la Investigación de la Reforma. Moeller ha participado en la publicación de casi 40 libros. Su Geschichte des Christentums in Grundzügen (Resumen de la historia del cristianismo) ha tenido diez ediciones. De particular importancia es Ökumenische Kirchengeschicht (Historia Ecuménica de la Iglesia), un proyecto editado conjuntamente con Raymond Kottje que apareció por primera vez en 1970. Esta obra mostró desde su primera aparición que la historia de la Iglesia había entrado en una nueva era. En 1998 recibió un doctorado honoris causa por la Universidad de Zurich .