El método de filtración biológica de Berlín es un método para mantener un entorno limpio y estable dentro de un acuario de agua salada , típicamente un sistema de arrecife de coral . Este método se basa en el uso de abundante roca viva (roca con organismos marinos vivos y bacterias sobre o en ella). La teoría es que las bacterias aeróbicas que cubren la superficie de la roca viva porosa y la arena convierten el amoníaco dañino (de los desechos de peces e invertebrados) en nitritos y luego nitratos , que son mucho menos dañinos para los habitantes del tanque. A través del proceso de difusión , los nitratos se mueven profundamente dentro de la roca donde son convertidos por bacterias anaeróbicas en gas nitrógeno libre. Los nitratos restantes se eliminan a través de cambios parciales de agua regulares o con filtración de algas, como un depurador de algas . Como medida adicional, se utiliza un separador de proteínas para eliminar algunos de los compuestos orgánicos disueltos antes de que se descompongan en amoníaco , aunque los separadores no eliminan el amoníaco de la urea de los peces.
La regla general es utilizar de 0,45 a 0,9 kg (1 a 2 lb) de roca viva por galón (EE. UU.) (3,7 litros) de agua del acuario, según la densidad de la roca, o llenar el tanque hasta 2/3 de su capacidad. El beneficio de utilizar roca viva es cuádruple: en primer lugar, la roca viva actúa como un filtro biológico, añadiendo bacterias beneficiosas. En segundo lugar, introduce una gran cantidad de vida marina en el acuario que muchos peces , invertebrados y corales utilizan como alimento. En tercer lugar, proporciona una apariencia de arrecife natural con amplios lugares para ubicar los corales. Por último, la roca viva también ayudará a equilibrar y estabilizar el pH en el acuario.
El calcio, la alcalinidad y otros oligoelementos que consumen los corales se reponen mediante cambios de agua (utilizando agua de mar natural o una mezcla de sal sintética de calidad) o mediante el uso de un reactor de calcio , kalkwasser (agua de calcio – hidróxido de calcio mezclado con agua pura) o una solución equilibrada de dos partes.