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Base de datos de genes del cáncer de cuello uterino

La base de datos de genes del cáncer cervical (CCDB) es una base de datos de genes involucrados en la carcinogénesis cervical . [1] La base de datos de cáncer cervical es la primera base de datos que ha sido curada manualmente. [2] La base de datos sirve como una entidad para que los médicos e investigadores examinen información básica, así como información avanzada sobre los genes que diferencian el cáncer cervical. [3] Hay 537 genes que han sido catalogados en la CCBD. Los genes que han sido catalogados se basan en el polimorfismo, la metilación, la amplificación de genes y el cambio en cómo se expresa el gen. Los investigadores científicos han examinado datos que comparan células cervicales normales con células cervicales malignas que se han utilizado para estudiar las diferentes expresiones genéticas que dan lugar al cáncer cervical. De las 500.000 mujeres que han sucumbido al cáncer cervical, la mayoría son de países en desarrollo, así como del bajo nivel socioeconómico en los países desarrollados. La CCBD está diseñada para presentar información que proporcionará nuevos tratamientos terapéuticos para la principal causa de cáncer dentro de la población de mujeres. [4]

Componentes

Usos

La base de datos sobre el cáncer de cuello uterino contiene datos que los usuarios (investigadores y médicos) del sistema pueden utilizar para averiguar si un gen conduce a la expresión del cáncer de cuello uterino. Los médicos e investigadores también podrán recopilar datos relacionados con los genes que pueden diferenciarse en el cáncer de cuello uterino. Existen varias formas de cáncer de cuello uterino que sufren hipermetilación. [5] La CCDB proporciona datos pertinentes sobre qué gen supresor de tumores silencia la expresión génica del cáncer de cuello uterino. [ cita requerida ]

Acceso

Los médicos o investigadores pueden buscar un gen utilizando el número de cromosoma, el identificador o el nombre del gen. [6] Los investigadores pueden agregar información sobre los genes que codifican el cáncer de cuello uterino, pero antes de que los datos se agreguen a la base de datos, deben ser validados por la comunidad científica. [7]

Véase también

Referencias

  1. ^ Agarwal, Subhash M; Raghav Dhwani; Singh Harinder; Raghava GPS (enero de 2011). "CCDB: una base de datos curada de genes involucrados en el cáncer de cuello uterino". Nucleic Acids Res . 39 (número de la base de datos). Inglaterra: D975–9. doi :10.1093/nar/gkq1024. PMC  3013652 . PMID  21045064.
  2. ^ Agarwal, SM; Agarwal, SM; Raghav, D.; Singh, H.; Raghava, GPS (2010). "CCDB: una base de datos curada de genes involucrados en la investigación de ácidos nucleicos del cáncer de cuello uterino". GPS .
  3. ^ Hakim, AA; Lin PS; Wilczynski S; Nguyen K; Lynes B; Wakabayashi MT. (2010). "Indicaciones y eficacia de la vacuna contra el virus del papiloma humano". Curr. Opciones de tratamiento Oncol . 8 (6): 393–401. doi :10.1007/s11864-007-0050-0. PMID  18172770. S2CID  207322276.
  4. ^ Phongsavan, Keokedthong; Phengsavanh, Alongkone; Wahlström, Rolf; Marions, Lena (junio de 2010). "Percepción de las mujeres sobre el cáncer de cuello uterino y su prevención en las zonas rurales de Laos". Revista internacional de cáncer ginecológico . 20 (5): 821–826. doi :10.1111/IGC.0b013e3181daaefb. PMID  20606529. S2CID  27963086.
  5. ^ Hagemann T, T.; Bozanovic, T; Hooper, S; Ljubic, A; Slettenaar, VI; Wilson, JL; Singh, N; Gayther, SA; et al. (2007). "Perfil molecular de la progresión del cáncer de cuello uterino". Br. J. Cancer . 96 (2): 321–328. doi :10.1038/sj.bjc.6603543. PMC 2360010 . PMID  17242701. 
  6. ^ Sayers, EW; Barrett T; Benson DA; Bolton E; Bryant SH; Canese K; Chetvernin V; Church DM; Dicuccio M; et al. (2010). "Recursos de la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica". Nucleic Acids Res . 38 (número de la base de datos): D5–D16. doi :10.1093/nar/gkp967. PMC 2808881 . PMID  19910364. 
  7. ^ Ongenaert, M; Van Neste L; De Meyer T; Menschaert G; Bekaert S; Van Criekinge W (2008). "PubMeth: una base de datos de metilación del cáncer que combina la minería de texto y la anotación de expertos". Nucleic Acids Res . 36 (número de la base de datos): D842–D846. doi :10.1093/nar/gkm788. PMC 2238841 . PMID  17932060. 

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