El volcán de San Salvador (también conocido como Quezaltepeque o El Boquerón ) es un estratovolcán situado al noroeste de la ciudad de San Salvador . El cráter ha sido casi rellenado por un edificio relativamente más nuevo, el volcán Boquerón. San Salvador está adyacente al volcán y la sección occidental de la ciudad se encuentra en realidad entre sus laderas. Debido a esta proximidad, cualquier actividad geológica del volcán, ya sea eruptiva o no, tiene el potencial de resultar en una destrucción catastrófica y muerte para la ciudad. A pesar de esto, el volcán es un icono de la ciudad, y varias antenas de televisión y radio están situadas en los picos de El Picacho y el cráter de Boquerón. El Picacho, el pico prominente, es el de mayor elevación (1.960 metros de altitud).
El edificio principal, conocido como el edificio Boquerón, se formó hace entre 700 y 1.000 años, rellenando una antigua caldera. La cresta en forma de medialuna en el lado noreste del volcán es un remanente del borde de la caldera. Las lavas del edificio Boquerón contienen más elementos alcalinos y óxido de hierro que las lavas del edificio más antiguo. Hace unos 800 años, el cráter actual se formó en una violenta explosión. El cráter, que le da el nombre actual (Boquerón significa "boca grande" en español) tiene 1,5 km de diámetro y 500 m de profundidad. Dentro del cráter alrededor de las paredes superiores, los lugareños que viven en el volcán cultivan cultivos.
La cámara de magma sobre la que se asienta el volcán contiene una serie de fisuras que sobresalen a lo largo de los flancos y lados del volcán. La fisura noroeste (N40W) ha sido la más activa recientemente, con eventos eruptivos tan importantes como la erupción de Loma Caldera que sepultó el antiguo pueblo de Cerén y la erupción de El Playón (1658-71) que sepultó el pueblo de Nejapa. Los ciudadanos se mudaron a Nejapa y hoy en día la erupción se celebra anualmente.
La erupción más reciente, en 1917, provocó una erupción en el flanco del volcán a lo largo de la fisura N40W. Durante esta erupción, el lago del cráter en el interior del Boquerón se evaporó y apareció un cono de ceniza , bautizado como 'Boqueroncito'.