Dos dinastías, la Taibugha y la dinastía Shaybanid de Sibir, gobernaron el Kanato una tras otra, rompiendo así la continuidad del gobierno de cada una.
Yermak Timofeyevich , un cosaco , dirigió la primera campaña de conquista rusa de Siberia durante el reinado de Iván el Terrible en 1580-1582. Sin embargo, Kuchum Khan regresó brevemente y atacó a Yermak el 6 de agosto de 1584 en la oscuridad de la noche y mató a la mayor parte de su ejército. Finalmente, en agosto de 1598, Küçhüm Khan fue derrotado en la batalla de Urmin cerca del río Ob . En el transcurso de la lucha, la familia real siberiana fue capturada por los rusos. Sin embargo, Küçhüm Khan escapó una vez más. Los rusos llevaron a los miembros de la familia de Küçhüm Khan a Moscú y allí permanecieron como rehenes. Los descendientes de la familia del kan se hicieron conocidos como los Príncipes Sibirsky y se sabe que la familia sobrevivió hasta al menos fines del siglo XIX. La lucha por el dominio de la región continuó durante varios años entre el sucesor de Taibughid, Syed Ahmed Khan, y el sucesor de Shaybanid, Ali ibn Kuchum Khan, así como los rusos.
Musa Bies: ¿posible Khan de Siberia? (1460-1496) .