Las nexinas clasificadoras son un gran grupo de proteínas que están localizadas en el citoplasma y tienen el potencial de asociarse a la membrana, ya sea a través de su dominio PX de unión a lípidos (un motivo de unión a fosfolípidos ) o a través de interacciones proteína-proteína con complejos proteicos asociados a la membrana . ] [3] Se ha demostrado que algunos miembros de esta familia facilitan la clasificación de proteínas .
Miembros de la familia
En los seres humanos, las nexinas clasificadoras se transcriben a partir de los siguientes genes:
Estructura
Las nexinas de clasificación constan únicamente de un dominio PX (por ejemplo, SNX3) o tienen una estructura modular formada por PX y dominios adicionales .
Un subgrupo de nexinas clasificadoras (que comprende, en humanos, SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 y SNX33) poseen un dominio BAR en su extremo C-terminal. (El dominio BAR de los SNX 1, 2, 4, 7, 8 y 30 está clasificado por pfam como 'similar a terminal Vps5 C').
Aquí se puede ver un ejemplo de una estructura de dominio nexin de clasificación para SNX1:
Diagrama esquemático de las estructuras 1D de una nexina de clasificación representativa, la nexina de clasificación 1 (SNX1). NTD = dominio SNX N-terminal, PX = dominio PX, CTD = dominio BAR C-terminal.
Referencias
^ Bravo J, Karathanassis D, Pacold CM y col. (octubre de 2001). "La estructura cristalina del dominio PX de p40 (phox) unido al fosfatidilinositol 3-fosfato". Mol. Celúla . 8 (4): 829–39. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00372-0 . PMID 11684018.
^ Dixon JE, Worby CA (2002). "Clasificación de las funciones celulares de clasificación de nexinas". Nat. Rev. Mol. Biol celular . 3 (12): 919–931. doi :10.1038/nrm974. PMID 12461558. S2CID 36361630.
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^ abcd Frost A, Unger VM, De Camilli P (abril de 2009). "La superfamilia del dominio BAR: macromoléculas moldeadoras de membranas". Celúla . 137 (2): 191-196. doi :10.1016/j.cell.2009.04.010. PMC 4832598 . PMID 19379681.
^ BAR_3_WASP_bdg: dominio de unión a WASP de la proteína Sorting nexin, Pfam PF10456
^ PXA: dominio PXA, Pfam PF02194
^ MIT: dominio MIT (transporte e interacción de microtúbulos), Pfam PF04212
^ RA: dominio de asociación Ras (RalGDS/AF-6), Pfam PF00788
