Timina-ADN glicosilasa

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La ADN glicosilasa de timina específica para el desajuste G/T es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen TDG . ^{[4] [5] [6]} Varias proteínas bacterianas tienen una fuerte homología de secuencia con esta proteína. ^[7]

Función

La proteína codificada por este gen pertenece a la familia de las glicosilasas de ADN TDG/mug . La glicosilasa de ADN-timina (TDG) elimina las fracciones de timina de los emparejamientos incorrectos G/T hidrolizando el enlace carbono-nitrógeno entre la cadena principal de azúcar-fosfato del ADN y la timina desapareada. Con una actividad menor, esta enzima también elimina la timina de los emparejamientos incorrectos C/T y T/T. La TDG también puede eliminar el uracilo y el 5-bromouracilo de los emparejamientos incorrectos con guanina. Los modelos de ratones con TDG inactivado no mostraron un aumento en la frecuencia de emparejamientos incorrectos, lo que sugiere que otras enzimas, como el homólogo funcional MBD4, pueden proporcionar redundancia funcional. Este gen puede tener un pseudogén en el brazo p del cromosoma 12. ^[6]

Además, en 2011, se informó que la ADN glicosilasa de timina humana (hTDG) escinde eficazmente la 5-formilcitosina (5fC) y la 5-carboxilcitosina (5caC), los productos de oxidación clave de la 5-metilcitosina en el ADN genómico. ^[8] Más tarde, se publicó la estructura cristalina del dominio catalítico de hTDG en complejo con ADN dúplex que contiene 5caC, lo que respalda el papel de TDG en la desmetilación de la 5-metilcitosina en mamíferos. ^[9]

Interacciones

Se ha demostrado que la timina-ADN glicosilasa interactúa con:

• Proteína de unión a CREB , ^[10]
• Receptor de estrógeno alfa , ^[11]
• Proteína de leucemia promielocítica , ^[12]
• SUMO3 , ^[13] y
• Pequeño modificador relacionado con la ubiquitina 1. [ ^{13] [14]}

Mapa interactivo de rutas

Haga clic en los genes, proteínas y metabolitos que aparecen a continuación para acceder a los artículos correspondientes. ^{[§ 1]}

1. El mapa de la ruta interactiva se puede editar en WikiPathways: "FluoropyrimidineActivity_WP1601".

Véase también

• ADN-desoxiinosina glicosilasa
• SMUG1
• Uracilo-ADN glicosilasa
• MBD4

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000139372 – Ensembl , mayo de 2017
2. "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
3. "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
4. Neddermann P, Gallinari P, Lettieri T, Schmid D, Truong O, Hsuan JJ, Wiebauer K, Jiricny J (agosto de 1996). "Clonación y expresión de la glicosilasa de ADN-timina específica para el desajuste G/T humano". J Biol Chem . 271 (22): 12767–74. doi : 10.1074/jbc.271.22.12767 . PMID:  8662714.
5. Sard L, Tornielli S, Gallinari P, Minoletti F, Jiricny J, Lettieri T, Pierotti MA, Sozzi G, Radice P (diciembre de 1997). "Localizaciones cromosómicas y análisis molecular de secuencias relacionadas con el gen TDG". Genómica . 44 (2): 222–6. doi :10.1006/geno.1997.4843. PMID  9299239.
6. "Entrez Gene: TDG timina-ADN glicosilasa".
7. Gallinari P, Jiricny J (octubre de 1996). "Una nueva clase de uracilo-ADN glicosilasas relacionadas con la timina-ADN glicosilasa humana". Nature . 383 (6602): 735–8. Bibcode :1996Natur.383..735G. doi :10.1038/383735a0. PMID  8878487. S2CID  4235485.
8. He YF, Li BZ, Li Z, Liu P, Wang Y, Tang Q, Ding J, Jia Y, Chen Z, Li L, Sun Y, Li X, Dai Q, Song CX, Zhang K, He C, Xu GL (septiembre de 2011). "Formación de 5-carboxilcitosina mediada por tet y su escisión por TDG en ADN de mamíferos". Science . 333 (6047): 1303–7. Bibcode :2011Sci...333.1303H. doi :10.1126/science.1210944. PMC 3462231 . PMID  21817016. 
9. Zhang L, Lu X, Lu J, Liang H, Dai Q, Xu GL, Luo C, Jiang H, He C (febrero de 2012). "La ADN glicosilasa de timina reconoce específicamente el ADN modificado con 5-carboxilcitosina". Nature Chemical Biology . 8 (4): 328–30. doi :10.1038/nchembio.914. PMC 3307914 . PMID  22327402. 
10. Tini M, Benecke A, Um SJ, Torchia J, Evans RM, Chambon P (febrero de 2002). "La asociación de la acetilasa CBP/p300 y la ADN glicosilasa de timina vincula la reparación y la transcripción del ADN". Mol. Cell . 9 (2): 265–77. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00453-7 . PMID  11864601.
11. Chen D, Lucey MJ, Phoenix F, Lopez-Garcia J, Hart SM, Losson R, Buluwela L, Coombes RC, Chambon P, Schär P, Ali S (octubre de 2003). "La glicosilasa de timina-ADN específica de la desadaptación T:G potencia la transcripción de genes regulados por estrógenos a través de la interacción directa con el receptor de estrógenos alfa". J. Biol. Chem . 278 (40): 38586–92. doi : 10.1074/jbc.M304286200 . PMID  12874288.
12. Takahashi H, Hatakeyama S, Saitoh H, Nakayama KI (febrero de 2005). "La actividad de unión no covalente de la ADN glicosilasa de timina (TDG) a SUMO-1 es necesaria para su modificación y colocalización con la proteína de leucemia promielocítica". J. Biol. Chem . 280 (7): 5611–21. doi : 10.1074/jbc.M408130200 . PMID  15569683.
13. Hardeland U, Steinacher R, Jiricny J, Schär P (marzo de 2002). "La modificación de la glicosilasa de ADN-timina humana por proteínas similares a la ubiquitina facilita el recambio enzimático". EMBO J . 21 (6): 1456–64. doi :10.1093/emboj/21.6.1456. PMC 125358 . PMID  11889051. 
14. Minty A, Dumont X, Kaghad M, Caput D (noviembre de 2000). "Modificación covalente de p73alpha por SUMO-1. La detección de dos híbridos con p73 identifica nuevas proteínas que interactúan con SUMO-1 y un motivo de interacción con SUMO-1". J. Biol. Chem . 275 (46): 36316–23. doi : 10.1074/jbc.M004293200 . PMID  10961991.

Lectura adicional

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• Hardeland U, Bentele M, Lettieri T, et al. (2001). "ADN glicosilasa de timina". Reparación por escisión de bases . Progreso en la investigación de ácidos nucleicos y biología molecular. Vol. 68. págs. 235–53. doi :10.1016/S0079-6603(01)68103-0. ISBN 978-0-12-540068-8. Número de identificación personal  11554300. {{cite book}}: |journal=ignorado ( ayuda )
• Chevray PM, Nathans D (1992). "Clonación por interacción de proteínas en levaduras: identificación de proteínas de mamíferos que reaccionan con la cremallera de leucina de Jun". Proc. Natl. Sci. USA . 89 (13): 5789–93. Bibcode :1992PNAS...89.5789C. doi : 10.1073/pnas.89.13.5789 . PMC  402103 . PMID  1631061.
• Neddermann P, Jiricny J (1994). "Eliminación eficiente de uracilo de pares GU erróneos por la ADN glicosilasa de timina específica para desajustes de células HeLa". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 91 (5): 1642–6. doi : 10.1073/pnas.91.5.1642 . PMC  43219 . PMID  8127859.
• Neddermann P, Jiricny J (1993). "La purificación de una glicosilasa de ADN-timina específica para desajustes a partir de células HeLa". J. Biol. Chem . 268 (28): 21218–24. doi : 10.1016/S0021-9258(19)36913-3 . PMID:  8407958.
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• He YF, Li BZ, Li Z, Liu P, Wang Y, Tang Q, Ding J, Jia Y, Chen Z, Li L, Sun Y, Li X, Dai Q, Song CX, Zhang K, He C, Xu GL (septiembre de 2011). "Formación de 5-carboxilcitosina mediada por tet y su escisión por TDG en ADN de mamíferos". Science . 333 (6047): 1303–7. Bibcode :2011Sci...333.1303H. doi :10.1126/science.1210944. PMC  3462231 . PMID  21817016.
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