La ribonucleasa T 1 ( EC 4.6.1.24, guanilorribonucleasa , ribonucleasa de Aspergillus oryzae , ARNasa N1 , ARNasa N2 , ribonucleasa N3 , ribonucleasa U1 , ribonucleasa F1 , ribonucleasa Ch , ribonucleasa PP1 , ribonucleasa SA , ARNasa F1 , ribonucleasa C2 , binasa , ARNasa Sa , ARNasa específica de guanilo , ARNasa G , ARNasa T 1 , ribonucleasa guaninenucleotido-2'-transferasa (ciclizante) , ribonucleasa N3 , ribonucleasa N1 ) es una endonucleasa fúngica que escinde el ARN monocatenario después de los residuos de guanina , es decir, en su extremo 3'; La forma más estudiada de esta enzima es la versión que se encuentra en el moho Aspergillus oryzae . Debido a su especificidad por la guanina, la RNasa T 1 se utiliza a menudo para digerir el ARN desnaturalizado antes de la secuenciación. Al igual que otras ribonucleasas como la barnasa y la RNasa A , la ribonucleasa T 1 ha sido popular para los estudios de plegamiento. [2]
Estructuralmente, la ribonucleasa T 1 es una proteína α+β pequeña (104 aminoácidos ) con una lámina beta antiparalela de cuatro cadenas que cubre una hélice alfa larga (casi cinco vueltas). La RNasa T 1 tiene dos enlaces disulfuro, Cys2-Cys10 y Cys6-Cys103, de los cuales el último contribuye más a su estabilidad de plegamiento; [3] la reducción completa de ambos disulfuros generalmente desdobla la proteína, aunque su plegamiento puede ser rescatado con altas concentraciones de sal. [4]
La ARNasa T 1 también tiene cuatro prolinas , dos de las cuales (Pro39 y Pro55) tienen isómeros cis de sus enlaces peptídicos X-Pro . Los isómeros no nativos de estas prolinas pueden retardar drásticamente el plegamiento conformacional, [5] plegándose en una escala de tiempo característica de 7000 segundos (casi dos horas) a 10 °C y pH 5. [6]