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Líder del rimP de gammaproteobacterias

El líder rimP γ-proteobacteriano es un supuesto elemento atenuador identificado por bioinformática dentro de las bacterias del filo γ-proteobacteriano. [1] Se encuentra aguas arriba del operón rimP-nusA-infB que codifica RimP, una proteína que se ha demostrado que participa en la maduración de la subunidad ribosómica 30S, [2] NusA, un factor transcripcional que controla la terminación y el factor de inicio de la traducción IF-2. respectivamente. El líder rimP presenta un terminador independiente de Rho en el extremo 3', correspondiente a un motivo GGGc(...)gCCC altamente conservado . Se supone que este motivo opera como un líder no codificante. Su mecanismo sigue siendo desconocido, pero es tentador especular sobre una implicación reguladora de la proteína NusA, cuya expresión se ha demostrado que reduce la expresión del operón, [3] [4] y que ya está implicada en la atenuación de Trp, His y operones S10. [5]

Referencias

  1. ^ Naville, M; Gautheret, D (2010). "El análisis del terminador prematuro arroja luz sobre un mundo oculto de atenuación transcripcional bacteriana". Biología del genoma . 11 (9): R97. doi : 10.1186/gb-2010-11-9-r97 . PMC  2965389 . PMID  20920266.
  2. ^ Nord S, Bylund GO, Lövgren JM, Wikström PM (2009). "La proteína RimP es importante para la maduración de la subunidad ribosómica 30S". J Mol Biol . 386 (3): 742–753. doi :10.1016/j.jmb.2008.12.076. PMID  19150615.
  3. ^ Plumbridge JA, Dondon J, Nakamura Y, Grunberg-Manago M (1985). "Efecto de la proteína NusA sobre la expresión del operón nusA, infB en E. coli". Ácidos nucleicos Res . 13 (9): 3371–3388. doi :10.1093/nar/13.9.3371. PMC 341241 . PMID  2987884. 
  4. ^ Nakamura Y, Plumbridge J, Dondon J, Grunberg-Manago M (1985). "Evidencia de la autorregulación del operón nusA-infB de Escherichia coli". Gen.​ 36 (1–2): 189–193. doi :10.1016/0378-1119(85)90085-X. PMID  2998933.
  5. ^ Worbs M, Bourenkov GP, Bartunik HD, Huber R, Wahl MC (2001). "Una superficie de unión de ARN extendida a través de dominios S1 y KH dispuestos en el factor de transcripción NusA". Célula Mol . 7 (6): 1177–1189. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00262-3 . PMID  11430821.

enlaces externos