El Korarchaeota es un filo propuesto dentro de Archaea . [3] El nombre se deriva del sustantivo griego koros o kore, que significa joven o mujer joven, y del adjetivo griego archaios que significa antiguo. [4] También se les conoce como Xenarchaeota . El nombre es equivalente a Candidatus Korarchaeota, y también reciben el nombre de Xenarchaeota o Xenarchaea. [5]
Taxonomía
Los Korarchaeota son un filo propuesto en el dominio Archaea . [6] Se cree que divergieron relativamente temprano en la génesis de Archaea y se encuentran entre los linajes de ramificación profunda. [6] Korarchaeota también se conoce como Xenarchaeota. Korarchaeaota, junto con Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, pertenecen al superfilo denominado TACK. [7] Aún se desconoce el vínculo evolutivo entre Asgard archaea y Korarchaeota de TACK (Thaumarchaeota, Aigarchaeota, Crenarchaeota, Korarchaeota). [7]
El primer miembro de Korarchaeota al que se le reconstruyó el genoma fue Korarchaeum crypotfilum , que se encontró en una fuente termal en el Parque Nacional de Yellowstone y se describió en 2008. [8] Desde entonces, sólo se han descrito unos pocos genomas de Korarchaeal. [9] Para comprobar la presencia de Korarchaeota, se recogieron muestras de una variedad de fuentes termales en Islandia y Kamchatka. Según las muestras y los análisis, las muestras islandesas contenían alrededor de 87 secuencias distintas de ácido nucleico ribosómico 16S, mientras que las muestras de Kamchatka contenían alrededor de 33. [10]
Basado en secuencias de proteínas y análisis filogenético de genes individuales conservados, el Korarchaeote fue identificado como un "linaje arqueal profundo" con una posible relación con el Crenarchaeota. [11] Además, dada la composición genética conocida de las arqueas, los Korarchaeota pueden haber conservado un conjunto de rasgos biológicos que corresponden a la forma de arqueas más antigua conocida. [11]
El análisis de las secuencias del gen 16S rRNA sugiere que son un linaje profundamente ramificado que no pertenece a los principales grupos de arqueas, Thermoproteota y Euryarchaeota . [12] El análisis del genoma de un korarchaeote que se enriqueció a partir de una cultura mixta reveló una serie de características similares a Crenarchaeota y Euryarchaeota y apoya la hipótesis de una ascendencia de ramificación profunda. [13]
A continuación se enumeran las especies conocidas de Korarcheota [14] Candidatus Korarchaeota
Género Candidatus Korarchaeota archaeon [15]
Género Candidatus Korarchaeota archaeon NZ13-K [15]
Género Candidatus Korarchaeum [6]
Especie Candidatus Korarchaeum cryptofilum [6]
Candidatus Korarchaeum criptofilum OPF8 [6]
Género Candidatus Methanodesulfokores [16]
Especie Candidatus Methanodesulfokores washburnensis [16]
Género Korarchaeote SRI-306 [15]
Muestras ambientales de género [15]
Korarchaeote pBA5 no cultivado [15]
Korarchaeote no cultivado pJP27 [15]
Korarchaeote no cultivado pJP78 [15]
Especies de referencia
Se cultivó una cepa de Korarchaeum cryptofilum a partir de un cultivo de enriquecimiento de una fuente termal en el Parque Nacional de Yellowstone, EE. UU., y se describió en 2008. [13] Las células son largas y con forma de aguja, lo que dio nombre a la especie, en alusión a su "críptica filamentos". Este organismo carece de genes para la biosíntesis de nucleótidos de purina y, por lo tanto, depende de fuentes ambientales para satisfacer sus necesidades de purina. [17]
Características
Korarchaeota es un filo propuesto dentro del dominio Archaea y, por lo tanto, exhibe características como tener una pared celular sin peptidoglicano, así como membranas lipídicas unidas por éter. [18] Tienen una capa superficial de proteína paracristalina. [19] Esta capa superficial, conocida como capa S, está densamente empaquetada y consta de 1 o 2 proteínas que forman varias estructuras reticulares y es muy probable que sea la que mantiene la integridad estructural de las células. [18] [19] Por lo general, tienen forma de varilla; sin embargo, se ha descubierto que esta morfología puede cambiar para tener una forma más gruesa en presencia de concentraciones más altas de dodecilsulfato de sodio (SDS). [20] Las células de Korarchaeota tienen una morfología filamentosa ultrafina que puede variar en longitud. [6] Por lo general, tienen un promedio de 15 μm de longitud y 0,16 μm de diámetro, pero se pueden ver hasta 100 μm de largo. [20] Algunas arqueas pueden fijar dióxido de carbono a través de la vía 3-hidroxipropionato/4-hidroxibutirato en compuestos orgánicos [21]
Ecología
Korarcheota solo se ha encontrado en ambientes hidrotermales que van desde terrestres, incluidas fuentes termales [6] [22] hasta marinos, incluidos respiraderos hidrotermales poco profundos y respiraderos hidrotermales de aguas profundas. [23] Investigaciones anteriores han demostrado una mayor diversidad de Korarchaea encontrada en aguas termales terrestres en comparación con los ambientes marinos. [23] Korarchaeota se ha encontrado en la naturaleza sólo en bajas abundancias. [24] [25] [26] Korarcheota probablemente se originó en ambientes marinos y luego se adaptó a los terrestres. [27]
Geográficamente, Korarcheota se ha encontrado en una variedad de lugares alrededor del mundo, incluidos Japón, el Parque Nacional de Yellowstone, el Golfo de California, Islandia y Rusia. [18] [23]
Los Korarchaeota son termófilos y se les ha encontrado viviendo en condiciones de hasta 128 grados centígrados. [23] La temperatura más baja en la que se han encontrado es de 52 grados Celsius. [18] Si bien se les ha observado con frecuencia viviendo en condiciones ácidas, también se ha encontrado que viven en condiciones de hasta un pH de 10. [28] [23]
Los investigadores han identificado un virus que potencialmente puede infectar a Korarcheota. [29]
Se descubrió que cada una de estas seis fuentes termales (en el sentido de las agujas del reloj desde arriba a la izquierda: Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) en Kamchatka contenía Korarchaeota. [24]
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