Juan de Saavedra fue un soldado al mando de Diego de Almagro . [1] : 234 En la primera expedición a Chile en 1535, Almagro envió a Saavedra a reconocer la costa de Chile en el barco que había traído refuerzos del Perú. Saavedra navegó hasta Alimapu, a la que llamó Valparaíso por su ciudad natal en España.
A su regreso de esta expedición, Hernando Pizarro intentó alistarlo en la guerra civil peruana, pero Saavedra optó por no tomar partido. Cuando supo que Cristóbal Vaca de Castro había llegado al Perú como gobernador real con plenos poderes, se unió a él. Se distinguió en la batalla de Chupas el 16 de septiembre de 1542. Tuvo tres hijos.