Juan Núñez II de Lara ( c. 1276 – 1315), apodado el Mozo o el de la Barba , fue un noble español , y jefe de la Casa de Lara al servicio del Reino de Castilla .
Entre otros títulos, fue Mayordomo Mayor del Rey en cuatro ocasiones y Adelantado Mayor de la Frontera de Andalucía . También fue titular nominal de la Sinyoría de Albarrazín, aunque esta se incorporó a la corona del Reino de Aragón en 1300.
Los padres de Juan fueron Juan Núñez I de Lara (m. 1294), cabeza de la Casa de Lara , y Teresa de Haro , hija de Diego López III de Haro , séptimo señor de Vizcaya y de Constanza de Bearne . Teresa era hermana de Lope Díaz III de Haro y de Diego López V de Haro , ambos señores de Vizcaya.
En las crónicas del rey Sancho IV de Castilla se dedica a este Juan Núñez una anécdota donde el monarca le confía el cuidado de su hijo, el infante Fernando .
Don Juan Nuñez, bien sabedes commo llegastes hasta mi mozo sin barbas, é fice vos mucha merced, lo uno en casamiento que vos dí muy bueno, é lo otro en cuantía, e ruego vos que pues yo so tan mal andante como vos vedes, que si yo muriere, que nunca vos desamparades al infante don Fernando, mi fijo, fasta que el hay a barbas é otrosí, que sirvades a la reina en toda su vida ça mucho vos lo meresció á vos é á tu linaje.
Según Carlos Estepa Díez, este texto revela que entre la infancia y la mayoría de edad, se puede deducir que Juan Núñez II fue llevado por primera vez ante el rey Sancho IV ( c. 1288 ), cuando tendría en torno a 12 o 14 años.
En 1290, tras un enfrentamiento que su padre mantuvo con el rey, la reina María de Molina propuso como solución, el matrimonio del hijo de Juan Núñez I con Isabel Alfonso de Molina, hija de Blanca Alfonso de Molina, media hermana de la reina y de Alfonso Fernández de Castilla el Niño , hijo ilegítimo del rey Alfonso X de Castilla .
A lo largo de su vida, Juan Núñez luchó contra Diego López V de Haro y Juan de Castilla y se alió con ellos en una lucha estratégica por el poder y la tierra y la influencia sobre el rey Fernando IV. Esta lucha que duró toda su vida culminó con la pérdida de la mayor parte de las tierras y territorios de Juan Núñez a manos del rey cuando se rindió a las fuerzas reales después de un prolongado asedio a su ciudad en Tordehumos .
Lara logró recuperar su estatus y algunos de sus títulos después de su participación y distinción en la invasión de Granada por parte de Fernando IV. Si bien la expedición terminó en fracaso, Lara realizó varias hazañas, incluida la toma de la ciudad de Gibraltar de manos de las fuerzas moras. También participó en el desastroso asedio de Algeciras de 1309 y se retiró con el ejército en 1310. Lara fue uno de los pocos seguidores del rey que no desertó de su servicio durante la guerra.
Según las crónicas del rey Alfonso XI de Castilla , Juan Núñez II de Lara murió en 1315 durante las Cortes de Burgos .
E fizo su testamento, y por que no avie fijo heredero nin fija que heredase después de su muerte, mandó para su alma a Lara que era suya y cuanto en el mundo avia. E los fijos dalgo de Castilla acordaron que la casa honrrada de Lara que no era bien que quedase sin señor, porque antiguamente fue un solar de los tres de Castilla; e con otorgamiento del rey y de los sus tutores y de todos los otros en general, dieron señor heredero a la casa de Lara, e este fue don Joan Nuñez,sobrino desde don Joan Nuñez de la Barba que fino, hijo de Joana su hermana e de don Fernando que llamavan de la Çerda (...)
En 1290 Juan se casó por primera vez con Isabel Alfonso de Molina, fallecida en 1292. Era hija de Alfonso Fernández de Castilla el Niño , hijo ilegítimo del rey Alfonso X de Castilla , y de Blanca Alfonso de Molina, señora de Molina y Mesa. Este matrimonio no produjo descendencia.
En 1295 se casó con María Díaz de Haro , hija del infante Juan de Castilla y de su esposa, María I Díaz de Haro . La pareja no tuvo hijos.
En 1300 contrajo nupcias por tercera vez con María Díaz III de Haro, hija de Diego López V de Haro , señor de Vizcaya , y de su esposa, la infanta Violante de Castilla y Aragón . Sin sucesión.
Sin descendencia de ninguno de sus tres matrimonios, unido a su hermano, Álvaro Núñez de Lara muriendo en 1287, al morir cedió todos sus títulos a su hermana, Juana Núñez de Lara . Ella se casó con el infante Fernando de la Cerda , nieto de Alfonso X de Castilla.