Juan I de Baviera (29 de noviembre de 1329 - 20 de diciembre de 1340) fue duque de la Baja Baviera desde 1339.
Juan I era hijo de Enrique XIV , duque de la Baja Baviera, y de Margarita de Bohemia . Sus abuelos maternos fueron Juan I de Bohemia e Isabel de Bohemia .
Se casó con Ana de Baviera (1326-3 de junio de 1361), hija de Luis IV de Baviera . Juan I, todavía menor de edad, fue el último duque de la Baja Baviera durante solo un año. Tras su temprana muerte en 1340, el ducado de la Baja Baviera pasó a manos de Luis IV, quien reunificó el ducado de Baviera en enero de 1341. Su madre, Margarita de Bohemia, como miembro de la dinastía de los Luxemburgo, tuvo que regresar a Bohemia.