Juan Federico III , también conocido como Juan Federico el Joven (16 de enero de 1538, Torgau - 21 de octubre de 1565, Jena ) fue un noble alemán. Fue duque titular de Sajonia de la rama ernestina de la Casa de Wettin . Recibió Sajonia-Gotha como heredad, pero dejó su administración a su hermano mayor.
Juan Federico fue el cuarto y más joven hijo del elector de Sajonia Juan Federico el Magnánimo (1503-1554) de su matrimonio con Sibila (1512-1554), hija del duque Juan III, duque de Cléveris .
Debido al abandono que sufrió durante su infancia, siempre estuvo enfermo y débil. Desde muy joven se interesó por la teología y estudió teología en la Universidad de Jena .
Tras la muerte de su padre en 1554, recibió Sajonia-Gotha como feudo . Como era menor de edad , él y sus posesiones quedaron bajo la tutela y regencia de su hermano mayor , Juan Federico II, hasta 1557. A partir de 1557, se le permitió gobernar Sajonia-Gotha en solitario. Sin embargo, firmó un contrato con su hermano mayor, que administraría el feudo durante cuatro años. En 1561, este contrato se prorrogó por otros cuatro años.
Juan Federico III murió soltero y sin hijos en 1565, a la edad de 27 años. Fue enterrado en la iglesia de la ciudad de Weimar. Debido a su personalidad, rara vez actuaba solo y generalmente era representado por sus hermanos.