Juan Cristián, duque de Schleswig-Holstein-Sonderburg (danés: Hans Christian af Slesvig-Holsten-Sønderborg , 26 de abril de 1607 - 30 de junio de 1653) fue duque de Schleswig-Holstein-Sonderburg desde 1627 hasta su muerte en 1653.
Juan Cristián era el hijo mayor de Alejandro, duque de Schleswig-Holstein-Sonderburg y Dorotea, hija de Juan Gunter I, conde de Schwarzburg-Sondershausen . Su padre lo había designado como su sucesor. Sin embargo, tras la muerte de su padre, su madre se hizo cargo de la administración del ducado, y Juan Cristián se vio obligado a pagar una compensación anual a sus hermanos. Esto llevó al ducado a una profunda deuda. Murió en Sønderborg en 1653, y fue sucedido por su hijo Cristián Adolfo I. [ 1]
Juan Cristián se casó con Ana de Oldenburg y Delmenhorst el 4 de noviembre de 1634. Tuvieron los siguientes hijos: