Jose V. Lopez es un biólogo molecular estadounidense-filipino . Ha sido miembro de la facultad y profesor de Biología en la Nova Southeastern University (NSU) [1] en Dania Beach, Florida , desde 2007. Lopez ha contribuido como cofundador de la Global Invertebrate Genomics Alliance (GIGA), una comunidad de científicos. También ha participado en los proyectos "Porifera—Tree of Life", " Earth Microbiome " y "Earth BioGenome " .
López obtuvo su licenciatura en el Instituto de Tecnología de Georgia . [ cita requerida ] Posteriormente obtuvo una maestría en ciencias enfocada en biología molecular en la Universidad Estatal de Florida [ cita requerida ] y su doctorado en Biología Ambiental y Políticas Públicas en la Universidad George Mason en Fairfax, supervisado por Stephen J. O'Brien . [2] Su tesis doctoral involucró la caracterización de las transposiciones de ADN mitocondrial en los núcleos de los gatos y la denominación de NUMT (ADN mitocondrial nuclear) como un fenómeno genómico evolutivo común. [3] El trabajo posterior ha involucrado la aplicación de la genética molecular a la simbiosis y la investigación de la biología marina (por ejemplo, corales y esponjas).
López aplicó su formación en evolución molecular en nombramientos postdoctorales con Nancy Knowlton , caracterizando el complejo de especies hermanas de coral Orbicella (anteriormente Montastraea ) annularis en el Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales en Panamá, y la genética de esponjas marinas con Shirley Pomponi en el Instituto Oceanográfico Harbor Branch en Ft. Pierce. [ cita requerida ] Esto último le permitió utilizar la tecnología sumergible Johnson Sea-Link para investigar esponjas y corales de aguas profundas. La investigación de López sobre esponjas marinas ha aparecido en un documental de PBS del sur de Florida "Esponjas: ¿son el animal más antiguo del mar?" en Changing Seas TV. [4] Mientras estuvo en la Facultad de Ciencias Naturales y Oceanografía Halmos de la NSU , su laboratorio ha aplicado herramientas genómicas para abordar varias preguntas específicas en la simbiosis entre invertebrados marinos y microbios , [5] ecología del microbioma, [6] [7] genómica, ciencia forense, metagenómica de organismos expuestos al petróleo, genómica de la conservación, [8] y sistemática/filogenética. López formó parte del Consorcio de Dinámica del Necto Pelágico Profundo (DEEPEND) del Golfo de México, dirigido por la bióloga marina Tracey T. Sutton, para comprender mejor las redes alimentarias y las distribuciones microbianas pelágicas en las profundidades del Golfo de México después del derrame de petróleo de Deepwater Horizon. López se ha desempeñado como editor asociado del Journal of Heredity desde 2008. En 2018, recibió el Premio al Profesor Distinguido del Presidente de la NSU. [9]
López cofundó la Global Invertebrate Genomics Alliance (GIGA), [10] que busca promover la investigación y la capacitación de estudiantes en la genómica de animales invertebrados marinos y acuáticos. [10] Después de algunas consultas iniciales con el genetista Stephen J. O'Brien y ver el éxito del primer proyecto de secuenciación genómica impulsada por taxones completos, Genome10K, López y colaboradores pasaron a formar GIGA en 2013. [11] Esto implicó llegar a una comunidad diversa de biólogos de invertebrados, que en su mayoría apoyaron el concepto. El apoyo para financiar un taller inaugural fue proporcionado por la Asociación Americana de Genética . GIGA se centra principalmente en animales acuáticos, pero tiene problemas similares (relativamente inaccesibles, animales individuales pequeños, bajo aporte de ADN para secuenciación) a los del consorcio de invertebrados más grande, Insect5K (i5K). [12] Tanto GIGA como i5K ahora ayudan a formar una "red de redes" como parte del Proyecto BioGenoma de la Tierra (EBP) , [13] lanzado en diciembre de 2018 para intentar secuenciar los genomas completos de 1,5 millones de eucariotas.
Además de la conocida simbiosis, [14] López inicialmente planteó la hipótesis de que los microbiomas de las esponjas podrían servir como indicadores de las comunidades en su entorno marino inmediato, ya que las esponjas se alimentan por filtración. Más tarde se demostró que esta hipótesis era solo parcialmente correcta (véase la clasificación de esponjas según su abundancia microbiana alta o baja (HMA, LMA), ya que la evidencia creciente indicaba que muchas especies de esponjas tienen sus propios simbiontes adaptados). [15]
López aplicó las herramientas moleculares independientes de la cultura que surgieron de la revolución woeseiana de la sistemática bacteriana basada en el ARN ribosómico. [16] Con el tiempo, las identificaciones moleculares se expandieron a los ecosistemas marinos locales como predictores de la calidad del agua, a los microbiomas de la piel humana como posibles herramientas forenses, [17] a las heces de murciélago Myotis para probar los posibles efectos del microbioma en la longevidad, [18] y a la cuenca del lago Okeechobee de Florida.
Es autor del libro “Evaluaciones y conservación de la diversidad biológica desde los arrecifes de coral hasta las profundidades marinas”, que aborda la biodiversidad marina de aguas profundas a través de perspectivas de genética, microbiología y evolución. [19]
Los padres de López son graduados de la Universidad de Filipinas , el patólogo clínico Ernesto G. y Rosario López, quienes se conocieron en Binghamton, Nueva York. [20] Está casado con Amy Doyle de Plantation, Florida . [ cita requerida ]
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