Joaquín Madariaga (1799 en Corrientes – 1848) fue un militar y político argentino . Madariaga fue gobernador de la provincia de Corrientes y líder de la resistencia provincial contra el gobierno nacional de Juan Manuel de Rosas .
Madariaga fue militar desde joven en la ciudad de Buenos Aires , y participó de los actos conocidos como la 'Anarquía de 1820'. Regresó en 1824 a Corrientes, donde trabajó como abogado sin haberse titulado y llegó a ser juez en la capital provincial.
Años más tarde se trasladó a Curuzú Cuatiá , donde se dedicó al trabajo rural. Fue diputado en la Legislatura Provincial durante la gobernación de Genaro Berón de Astrada y tras la muerte del gobernador apoyó la revolución que derrocó al gobernador federal Romero. Pedro Ferré nombró comandante de Mercedes y Curuzú Cuatiá al hermano de Joaquín, Juan Madariaga . Ayudó a Juan Lavalle a formar el ejército con el que dirigió la campaña de Entre Ríos en 1840.
A la llegada de José María Paz a Corrientes , participó en la campaña contra la primera invasión del Gobernador de Entre Ríos , Pascual Echagüe . Junto a su hermano, Juan luchó en la Batalla de Caaguazú , la victoria más brillante de Paz. En 1842 fueron derrotados en la Batalla de Arroyo Grande. Se retiraron hacia Corrientes pero el gobierno de Ferré se lo negó, obligándolos a retirarse a sus ranchos para salvar a su familia y sus propiedades. De allí huyeron a Brasil, residiendo algún tiempo en Alegrete .
El 1 de abril de 1843, los hermanos Madariaga y algunos funcionarios más cruzaron el río Uruguay cerca de Uruguaiana , en lo que luego se conocería como el 'Paso de los Libres'. Con el apoyo de algunos dirigentes como Nicanor Cáceres y Benjamín Virasoro, en trece días ocuparon toda la provincia, obligando al gobernador Pedro Cabral a huir hacia Entre Ríos. La última resistencia federal fue derrotada a principios de mayo en la batalla de Laguna Brava.
Los hermanos Madariaga convocaron una legislatura de apoyo que nombró gobernador a Joaquín Madariaga. Asumió ese cargo el 1 de agosto de 1843. Su primera medida fue anular las medidas dictadas por Cabral y sancionar a Ferré por haber abandonado la provincia.
Formó un partido unitario distinto del que había apoyado a Ferré entre los que se encontraban Juan Pujol, Valdez y Acosta; más tarde, esta sería la base del partido liberal, y sus oponentes, como los partidarios de Ferré y Virasoro, pasarían a ser el partido autonomista.
En diciembre de 1843 ambos hermanos invadieron Entre Ríos aprovechando que Urquiza se encontraba en Uruguay persiguiendo a Rivera. La reserva entrerriana de Eugenio Garzón fue derrotada, pero al llegar a Concepción del Uruguay se enteraron de que Urquiza había derrotado a Rivera y regresaba. La retirada que siguió se transformó en huida y perdieron todo lo que habían ganado.
Recién regresado a Corrientes confiscó un cargamento paraguayo que navegaba por el río Paraná. El gobierno de Carlos Antonio López estuvo a punto de declarar la guerra pero Santiago Derqui logró negociar un tratado de paz, un tratado de navegación y comercio y poco después una alianza contra los Rosas.
En noviembre de 1844 el general Paz llegó a Corrientes, e inmediatamente Madariaga lo puso al mando de las fuerzas provinciales. El general dedicó muchos meses a entrenar a las tropas inexpertas. En junio de 1845 envió una expedición a Santa Fe al mando del exgobernador Juan Pablo López, aunque sin éxito.
A principios del año siguiente se constituyó una fuerza de 3.000 paraguayos bajo el control del hijo del actual presidente y futuro presidente Francisco Solano López . Un poco más tarde, Urquiza invadió Corrientes y derrotó y tomó prisionero a Juan Madariaga en Laguna Limpia. No intentó atacar las posiciones defensivas de Paz sino que retrocedió. Rápidamente puso en libertad al hermano del gobernador y firmó un tratado de paz.
El general Paz decidió derrocar a los hermanos Madariaga. Para su sorpresa, las tropas se mantuvieron leales y tuvo que huir a Paraguay. El presidente López retiró su ejército y canceló la alianza.
Libres de la arrogancia de Paz, las negociaciones avanzaron rápidamente y en agosto de 1846 se firmó el Tratado de Alcaraz. Mediante esto Corrientes fue reincorporado a la Confederación y el control de las relaciones exteriores fue devuelto a Rosas; sin embargo, Corrientes quedó liberado de la obligación de apoyar la Gran Guerra en Uruguay. Rosas exigió modificaciones al tratado pero fueron rechazadas por Madariaga.
En marzo del año siguiente, Rosas ordenó a Urquiza atacar a Madariaga en Corrientes. El coronel Virasora unió fuerzas con Urquiza en la invasión que se inició a finales de ese año. El 27 de noviembre de 1847, Urquiza destrozó al ejército correntino controlado por los hermanos Madriaga en la Batalla de Vences o del Potrero de Vences. Los correntianos sufrieron 700 muertes y 2.200 prisioneros, muchos de los cuales fueron ejecutados después de la batalla.
Al día siguiente, el coronel Miguel Virasoro ocupó el gobierno que dejaría al general Benjamín Madariaga un mes después. Casi solo, el ex gobernador Madariaga huyó a Paraguay y se dirigió a Asunción , donde planeaba arrastrar al presidente López a la guerra contra Rosas. Fracasó y se fue a Porto Alegre, Brasil , donde murió en febrero de 1848.