William James Kent (nacido el 10 de febrero de 1960) es un científico investigador y programador informático estadounidense . Ha colaborado en proyectos de bases de datos del genoma y fue ganador del premio Benjamin Franklin en 2003 .
Kent nació en Hawaii y creció en San Francisco, California , Estados Unidos .
Kent comenzó su carrera de programación en 1983 con Island Graphics Inc., donde escribió el programa Aegis Animator para el ordenador doméstico Amiga . Este programa combinaba la interpolación de polígonos en 3D con una animación sencilla basada en celdas 2D. En 1985 fundó y dirigió una empresa de software, Dancing Flame, que adaptó el Aegis Animator al Atari ST [2] y creó Cyber Paint [3] para esa máquina. Cyber Paint era un programa de animación 2D que reunía una amplia variedad de funciones de animación y pintura y el formato de animación con compresión delta desarrollado para CAD-3D. El usuario podía moverse libremente entre los fotogramas de la animación y pintar de forma arbitraria, o utilizar varias herramientas de animación para el movimiento automático de interpolación a través de los fotogramas. Cyber Paint fue uno de los primeros programas de consumo, si no el primero, que permitía al usuario pintar a lo largo del tiempo en un formato de vídeo digital comprimido. Más tarde, desarrolló un programa similar, el Autodesk Animator para PC compatibles , donde la compresión de imágenes mejoró hasta el punto de que se podía reproducir desde el disco duro y se podía pintar utilizando "tintas" que realizaban transformaciones algorítmicas como suavizado, transparencia y patrones en mosaico. El Autodesk Animator se utilizó para crear ilustraciones para una amplia variedad de videojuegos. [4]
En 2000, escribió un programa, GigAssembler, [5] que permitió al Proyecto Genoma Humano, financiado con fondos públicos , ensamblar y publicar la primera secuencia del genoma humano. Sus esfuerzos estuvieron motivados por las necesidades de investigación de él y sus colegas, pero también por la preocupación de que los datos pudieran convertirse en propiedad privada a través de patentes de Celera Genomics . [6] En su reñida carrera con Celera, Kent y el profesor de la UCSC David Haussler construyeron rápidamente un modesto grupo de 50 computadoras personales de consumo que ejecutaban un sistema operativo basado en Linux para ejecutar el software. En contraste, Celera estaba usando lo que entonces se pensaba que era una de las supercomputadoras civiles más poderosas del mundo. El primer ensamblaje de Kent sobre el genoma humano se publicó el 22 de junio. Celera terminó su ensamblaje tres días después, el 25 de junio, y los resultados duales se anunciaron en la Casa Blanca el 26 de junio. El 7 de julio de 2000, los datos de Santa Cruz se pusieron a disposición del público en la World Wide Web, mientras que el artículo de investigación que describe este genoma financiado con fondos públicos se publicó en la edición especial de febrero de 2001 de Nature , [7] en paralelo con los resultados de Celera en la revista Science . [8] En 2002, Tim O'Reilly describió el trabajo de Kent como "el trabajo más significativo de desarrollo de código abierto en el último año". Si bien todo el software de genómica de Kent es de código abierto en el sentido de que el código fuente se puede descargar y leer de forma gratuita, y todo el software se puede usar libremente para uso académico, sin fines de lucro y personal, parte de él requiere una licencia , ya sea de UCSC o de Kent Informatics Inc., para uso comercial. [9]
Después de GigAssembler, Kent continuó escribiendo BLAT (herramienta de alineación similar a BLAST) [10] y el UCSC Genome Browser [11] para ayudar a analizar datos importantes del genoma. Kent continúa trabajando en UCSC principalmente en herramientas web para ayudar a comprender el genoma humano. Ayuda a mantener y actualizar el navegador, y ha trabajado en genómica comparativa , [12] Parasol, un software de gestión de control de trabajos para el kilocluster UCSC, y el Proyecto ENCODE .