bioestadístico americano
Jeffrey Tullis Leek es un bioestadístico y científico de datos estadounidense que trabaja como vicepresidente, director de datos y profesor en el Centro de investigación del cáncer Fred Hutchinson . [1] [2] Es autor del blog Simply Statistics y dirige varios cursos en línea a través de Coursera , como parte de su especialización en ciencia de datos. [3] [4] [5] Su curso más popular es The Data Scientist's Toolbox, [6] que impartió junto con Roger Peng y Brian Caffo . Leek es mejor conocido por sus contribuciones al análisis de datos genómicos y su visión crítica de la investigación y la precisión de los métodos estadísticos populares.
Educación
Leek se graduó de la Universidad Estatal de Utah en 2003 con su Licenciatura en Ciencias. Luego pasó a estudiar en la Universidad de Washington obteniendo una maestría en 2005 y completó un doctorado en Bioestadística en 2007 con John Storey como su asesor doctoral. [2] [7]
Investigación y carrera
Leek se unió a la Universidad Johns Hopkins como profesor asistente de Bioestadística en 2009, trabajando en la Escuela de Salud Pública Bloomberg . En 2014 se convirtió en profesor asociado de Bioestadística y Oncología . [8]
Leek trabaja en el Centro de Biología Computacional [9] de la Universidad Johns Hopkins creando paquetes estadísticos [10] [11] para análisis de genomas.
También coedita un blog, Simply Statistics [12] con Roger Peng y Rafa Irizarry, que contiene una combinación de artículos sobre estadística y metainvestigación .
Leek ha impartido varias charlas en universidades y lugares prestigiosos, como una serie de coloquios en Harvard [13] y una conferencia en el Centro del Genoma de Nueva York titulada “Construcción de un recurso integral para el estudio de la expresión genética humana con aprendizaje automático y ciencia de datos” [ 14] como parte de su serie de conferencias.
Es un experto en reproducibilidad y sus trabajos y opiniones han sido publicados en destacadas revistas científicas y médicas como Nature [15] [16] y Proceedings of the National Academy of Sciences. Leek escribió un libro autoeditado, The Elements of Data Analytic Style y es considerado un experto en replicación. [17] [18]
Actualmente es vicepresidente y director de datos del Fred Hutchinson Cancer Center en Seattle, WA. [2]
Reconocimiento
Leek fue elegido miembro de la Asociación Estadounidense de Estadística en 2020. [19] En 2021, Leek ganó el Premio de los Presidentes de la COPSS . [20]
Publicaciones Seleccionadas
Las obras más citadas de Leek incluyen
- "Captura de heterogeneidad en estudios de expresión genética mediante análisis de variables sustitutas" [21]
- "Abordar el impacto generalizado y crítico de los efectos por lotes en datos de alto rendimiento" [22]
Referencias
- ^ "El Dr. Jeffrey Leek nombrado vicepresidente y director de datos". 11 de enero de 2022.
- ^ a b "Jeff Leek, Ph.D." Fred Hutch . Consultado el 19 de febrero de 2023 .
- ^ "Acerca de". Simplemente Estadísticas.
- ^ Diane Peters (22 de febrero de 2018). "Los MOOC no están muertos, sino evolucionando". Asuntos Universitarios.
- ^ Steven Salzberg (13 de abril de 2015). "¿Cuán disruptivos son los MOOC? Hopkins Genomics MOOC se lanza en junio". Forbes .
- ^ "Coursera: caja de herramientas para científicos de datos".
- ^ "Simply Statistics: entrevista con el ganador del premio COPSS, John Storey". Simplemente Estadísticas . Consultado el 19 de febrero de 2023 .
- ^ "Jeff Puerro". LinkedIn.
- ^ "Centro de Biología Computacional". Universidad Johns Hopkins.
- ^ "Software desarrollado por Jeffrey Leek".
- ^ "Software desarrollado por el Centro de Biología Computacional".
- ^ "Simplemente estadísticas".
- ^ "¿Qué nos pueden decir más de 20.000 muestras de RNA-seq sobre qué parte del genoma se transcribe?". Seminario Coloquio de Harvard. 16 de febrero de 2016.
- ^ Jeff Puerro. "Construcción de un recurso integral para el estudio de la expresión genética humana con aprendizaje automático y ciencia de datos". Conferencia del Centro del Genoma de Nueva York.
- ^ Puerro, Jeff; Peng, Roger (28 de abril de 2015). "Estadísticas: los valores de P son sólo la punta del iceberg". Naturaleza . 520 (7549): 612. Bibcode :2015Natur.520..612L. doi : 10.1038/520612a . PMID 25925460. S2CID 4465756.
- ^ Puerro, Jeff; McShane, Blakeley; Gelman, Andrés; Colquhoun, David; Nuijten, Michele; Goodman, Steven (28 de noviembre de 2017). "Cinco formas de arreglar las estadísticas". Naturaleza . 551 (7682): 557–559. doi : 10.1038/d41586-017-07522-z .
- ^ Los elementos del estilo analítico de datos. Leanpub. 20 de febrero de 2014.
- ^ Karen Nitkin (7 de noviembre de 2017). "¿Podría repetirlo? Solucionar la 'crisis de replicación' en la investigación biomédica se ha convertido en la máxima prioridad". Centro.
- ^ "Lista de becarios de ASA". Asociación Estadounidense de Estadística . Consultado el 1 de junio de 2020 .
- ^ "Jeffrey T. Leek gana el premio de los presidentes de COPSS | Amstat News". Noticias de Amstat . 2021-11-01 . Consultado el 31 de enero de 2024 .
- ^ Puerro, Jeff; Piso, John (28 de septiembre de 2007). "Captura de heterogeneidad en estudios de expresión génica mediante análisis de variables sustitutas". PLOS Genética . 3 (9): 1724–35. doi : 10.1371/journal.pgen.0030161 . PMC 1994707 . PMID 17907809. S2CID 151500.
- ^ Puerro, Jeff; Scharpf, Robert; Corrado Bravo, Héctor; Simjá, David; Langmead, Benjamín; Johnson, Evan; Alemán, Donald; Baggerly, Keith; Irizarry, Rafael (1 de octubre de 2010). "Abordar el impacto crítico y generalizado de los efectos por lotes en datos de alto rendimiento". Naturaleza Reseñas Genética . 11 (10): 733–9. doi :10.1038/nrg2825. PMC 3880143 . PMID 20838408.