John Lee Hubby (19 de marzo de 1932 - 28 de marzo de 1996) fue un genetista estadounidense, pionero de la electroforesis en gel y coautor, con Richard Lewontin , de estudios fundamentales en el campo de la evolución molecular .
Después de obtener un doctorado de la Universidad de Texas en Austin en 1959, Hubby aceptó una beca postdoctoral en la Universidad de Chicago , seguida de un puesto de profesor allí. A principios de la década de 1960, desarrolló nuevas aplicaciones para la electroforesis en gel. Aplicó la técnica para identificar diferentes versiones de la misma proteína, que reflejan diferentes alelos para el mismo locus genético , en moscas de la fruta. Hubby colaboró con Lewontin para producir dos artículos innovadores en 1966 que usaban la electroforesis para determinar el nivel de variación genética en poblaciones naturales de Drosophila pseudoobscura . Sus estudios revelaron altos niveles de heterocigosidad en relación con las predicciones de la mayoría de los teóricos evolutivos, y fueron pioneros en el estudio de la evolución molecular [1]