Inparanoid es un algoritmo que encuentra genes ortólogos y genes parálogos que surgieron, muy probablemente por duplicación , después de algún evento de especiación . Estos genes que codifican proteínas se denominan in-parálogos , a diferencia de los out-parálogos (que surgieron antes de una división de especies). [1]
Inparanoid (con distintas mayúsculas y minúsculas) puede referirse a un programa que utiliza el algoritmo INPARANOID o a la base de datos derivada de grupos ortólogos de genes. [2]
Véase también
Referencias
- ^ Remm, Maido; Christian EV Storm; Erik LL Sonnhammer (2001). "Agrupamiento automático de ortólogos y parálogos a partir de comparaciones de especies por pares". Journal of Molecular Biology . 314 (5): 1041–1052. CiteSeerX 10.1.1.328.6724 . doi :10.1006/jmbi.2000.5197. PMID 11743721.
- ^ O'Brien, KP; Remm, M.; Sonnhammer, ELL (2005). "Inparanoid: una base de datos completa de ortólogos eucariotas". Nucleic Acids Research . 33 (Número de base de datos): D476–80. doi :10.1093/nar/gki107. PMC 540061 . PMID 15608241.
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