QIAGEN Silicon Valley (anteriormente Ingenuity Systems ) es una empresa con sede en Redwood City, California , EE. UU., que desarrolla software para analizar sistemas biológicos complejos. El primer producto de QIAGEN Silicon Valley, IPA, se introdujo en 2003 y se utiliza para ayudar a los investigadores a analizar datos ómicos y modelar sistemas biológicos. El software ha sido citado en miles de publicaciones científicas de biología molecular y es una de varias herramientas para investigadores de biología de sistemas y bioinformáticos en el descubrimiento de fármacos y la investigación institucional.
Todos los productos de QIAGEN Silicon Valley utilizan la base de conocimientos Ingenuity, que contiene interacciones biológicas y químicas y anotaciones funcionales creadas a partir de millones de relaciones modeladas individualmente entre proteínas, genes, complejos, células, tejidos, fármacos y enfermedades. [ cita necesaria ] Cada relación se origina a partir de hechos experimentales informados de fuentes bibliográficas primarias, incluidos artículos de revistas revisados por pares [ cita necesaria ] y libros de texto [ cita necesaria ] . El proceso de adquisición y extracción de conocimientos está protegido por múltiples patentes estadounidenses. [1]
La IPA se adopta ampliamente [ ¿según quién? ] en la comunidad de ciencias biológicas y ha sido citado en miles de artículos de revistas revisados por pares. [2] IPA se puede utilizar con o sin datos. IPA ayuda a los investigadores a analizar datos derivados de microarrays de expresión y SNP , experimentos proteómicos y experimentos a pequeña escala que generan listas de genes, para obtener información sobre las interacciones moleculares y químicas, los fenotipos celulares y los procesos de enfermedades dentro de un sistema. IPA también permite a los investigadores buscar información sobre genes, proteínas, sustancias químicas, fármacos y reactivos . La información resultante se puede utilizar para construir modelos biológicos, diseñar experimentos o ponerse al día en un área de investigación. [3]
Ingenuity ofrece herramientas de búsqueda y visualización para sitios web de comercio electrónico relacionados con la ciencia. Ingenuity tiene dos asociaciones destacadas: Sigma-Aldrich aprovecha la tecnología Ingenuity en su aplicación Your Favourite Gene , y BD Biosciences aprovecha la tecnología Ingenuity en su aplicación BD Cell Pathways [4] .
2003 - Ingenuity ofrece por primera vez la base de conocimientos Ingenuity [5]
2004 - La Universidad de Stanford otorga licencias IPA [6]
2004 - Un análisis independiente encuentra un retorno de la inversión significativo para las compañías farmacéuticas que utilizan IPA [7]
2005 - La Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. adopta IPA para revisar las presentaciones de farmacogenómica [8 ]
2006 - Ingenuity se asocia con Asuragen, Spotfire, Agilent, Genedata e Inforsense [9]
2007 - Ingenuity introduce capacidades de toxicología y biomarcadores dentro de IPA 5.0 [10]
2007 - IPA 5.0 gana el premio Best in Show - Mejor producto nuevo en Bio- IT World [11]
2007 - Ingenuity y la FDA inician una colaboración de tres años para mejorar el proceso de revisión regulatoria [12]
2008 - La característica más nueva de IPA, Path Designer, gana el premio al Mejor Producto Nuevo en Molecular Medicine [13]
2009 - Sigma Aldrich lanza Your Favourite Gene - Desarrollado por Ingenuity [14]
2009 - BD Biosciences lanza BD Cell Pathways, impulsado por Ingenuity [15]
2011 - Ingenuity anuncia acceso temprano a Ingenuity iReport [16]
2012 - Ingenuity anuncia la disponibilidad comercial de Ingenuity iReport e Ingenuity Variant Analysis [17] [ 18]
2013: Ingenuity anuncia colaboraciones con Laboratory Corporation y Quest Diagnostics para desarrollar una solución para calificar la variación genética para datos de secuenciación (NGS) de próxima generación y QIAGEN lo compra en mayo del mismo año.