Las elecciones a la alcaldía de Boston de 2001 se celebraron el martes 6 de noviembre de 2001, entre el alcalde en ejercicio Thomas Menino y la concejala Peggy Davis-Mullen . Menino fue reelegido para un tercer mandato.
Las elecciones preliminares municipales no partidistas se celebraron el 25 de septiembre de 2001. Davis-Mullen, al quedar en segundo lugar, se convirtió en la segunda mujer en ser finalista para alcaldesa en la historia de la ciudad.