Hernán Ruiz el Joven (a veces escrito Hernán Ruiz II ; c. 1514 – 21 de abril de 1569) fue un arquitecto renacentista español, activo principalmente en Andalucía .
Nació en Córdoba o Burgos , hijo del también arquitecto Hernán Ruiz el Viejo. Entre sus actividades destacan la de director de la construcción de la Catedral de Córdoba (desde 1547) y de Sevilla (desde 1557), el baptisterio de San Nicolás de la Villa (1540-1554), la Casa Consistorial de Sevilla , el Hospital de las Cinco Llagas y otras, entre ellas el campanario de la Giralda.
Murió en Sevilla en 1569. Su hijo Hernán también fue arquitecto.