Regresión de Haseman-Elston

Técnica de regresión de ligamiento genético

En genética estadística , la regresión de Haseman-Elston (HE) es una forma de regresión estadística propuesta originalmente para el análisis de ligamiento de rasgos cuantitativos para pares de hermanos . Fue desarrollada por primera vez por Joseph K. Haseman y Robert C. Elston en 1972. ^[1] Una fuente mucho más temprana de implementación de ligamiento de pares de hermanos fue, en 1935 y 1938, ^{[2] [3]} propuesta por Lionel S. Penrose , quien es el padre del físico teórico premio Nobel Roger Penrose . En 2000, Elston et al. propusieron una forma "revisada" y extendida de la regresión de Haseman-Elston. ^[4] Desde entonces, se han propuesto extensiones adicionales a la forma "revisada" de la regresión HE. ^{[5] [6] [7]} Aunque la regresión HE "...parece un arma oxidada en el arsenal de análisis genómico de la era GWAS . Esto se debe a que la regresión HE se basa en la relación medida en IBD pero no en la identidad por estado (IBS)...", HE ha sido adaptada para el análisis de asociación en muestras no relacionadas, cuya relación se mide en IBS. ^[8]

Referencias

1. Haseman, JK; Elston, RC (marzo de 1972). "La investigación del vínculo entre un rasgo cuantitativo y un locus marcador". Genética del comportamiento . 2 (1): 3–19. doi :10.1007/BF01066731. ISSN  0001-8244. PMID  4157472. S2CID  38976975.
2. Penrose, LS (1935). "La detección de ligamiento autosómico en datos que consisten en pares de hermanos y hermanas de filiación no especificada". Anales de eugenesia . 6 (2): 133-8. doi : 10.1111/j.1469-1809.1935.tb02224.x . ISSN  1469-1809.
3. Penrose, LS (1938). "Enlace genético en caracteres humanos graduados". Anales de eugenesia . 8 (3): 233-7. doi : 10.1111/j.1469-1809.1938.tb02176.x . ISSN  1469-1809.
4. Elston, Robert C.; Buxbaum, Sarah; Jacobs, Kevin B.; Olson, Jane M. (2000). "Haseman y Elston revisitados". Epidemiología genética (en francés). 19 (1): 1–17. doi :10.1002/1098-2272(200007)19:1<1::AID-GEPI1>3.0.CO;2-E. ISSN  1098-2272. PMID  10861893. S2CID  25757183.
5. Mirea, Lucia; Bull, Shelley B; Stafford, James (2003). "Comparación de los análisis de regresión de Haseman-Elston utilizando medidas únicas, resumidas y longitudinales de la presión arterial sistólica". BMC Genetics . 4 (Supl 1): S23. doi : 10.1186/1471-2156-4-S1-S23 . PMC 1866458 . PMID  14975091. 
6. Sham, PC; Purcell, S. (junio de 2001). "Equivalencia entre análisis de ligamiento de componentes de varianza y Haseman-Elston para pares de hermanos". The American Journal of Human Genetics . 68 (6): 1527–1532. doi :10.1086/320593. PMC 1226141 . PMID  11353401. 
7. Wang, Tao; Elston, Robert C. (julio de 2005). "Regresión de Haseman-Elston de dos niveles para el análisis de datos genealógicos generales". Epidemiología genética . 29 (1): 12–22. doi :10.1002/gepi.20075. ISSN  0741-0395. PMID  15838848. S2CID  5815750.
8. Chen, Guo-Bo (30 de abril de 2014). "Estimación de la heredabilidad de rasgos complejos a partir de estudios de asociación de todo el genoma utilizando la regresión de Haseman-Elston basada en IBS". Frontiers in Genetics . 5 : 107. doi : 10.3389/fgene.2014.00107 . ISSN  1664-8021. PMC 4012219 . PMID  24817879.