stringtranslate.com

Haplogrupo Y

En la genética mitocondrial humana , el haplogrupo Y es un haplogrupo de ADN mitocondrial (ADNmt) humano .

Origen

El haplogrupo Y es descendiente del haplogrupo N9 . [ cita requerida ]

Distribución

El haplogrupo Y se ha encontrado con alta frecuencia en muchas poblaciones indígenas que viven alrededor del Mar de Ojotsk , incluyendo aproximadamente el 66% de los Nivkhs , aproximadamente el 43% de los Ulchs , [2] aproximadamente el 40% de los Nanais , aproximadamente el 21% de los Negidals y aproximadamente el 20% de los Ainus . [3] [4] [5] [6] [7] También es bastante común entre los pueblos indígenas de la península de Kamchatka (Koryaks, Itelmens) y entre ciertos pueblos austronesios (especialmente grupos estrechamente relacionados con los nativos taiwaneses).

La distribución del haplogrupo Y en las poblaciones del archipiélago malayo contrasta marcadamente con la ausencia o extrema rareza de este clado en las poblaciones del sudeste asiático continental de una manera que recuerda al haplogrupo E. Sin embargo, la frecuencia del haplogrupo Y se desvanece más suavemente a partir de su máximo alrededor del mar de Ojotsk en el noreste de Asia, y se encuentra en aproximadamente el 2% de los coreanos [4] y en las poblaciones del sur de Siberia y Asia central con una frecuencia promedio del 1%. [8] [9]

El subclado Y2 se ha observado en el 40% (176/440) de un gran grupo de muestras del pueblo Nias en el oeste de Indonesia, desde un mínimo del 25% (3/12) entre la subpoblación Zalukhu hasta un máximo del 52% (11/21) entre la subpoblación Ho. [10]

Tabla de frecuencias del haplogrupo Y del ADNmt

Subclados

El haplogrupo Y se ha dividido en dos subclados principales, Y1 e Y2. En un estudio publicado en 2016, se observó el haplogrupo Y1a de ADNmt en un Ulchi muestreado en Nizhniy Gavan, Bajo Amur, mientras que el haplogrupo Y2a1 de ADNmt se observó en un Igorot de la provincia de Mountain, isla de Luzón, Filipinas (muestreado en Singapur) y en un hawaiano . [21]

Y1 predomina en el rango del noreste asiático del haplogrupo Y, que está centrado en el Mar de Ojotsk . Y1* se ha observado en dos uigures , un chino Minnan Han en Taiwán y un Khamnigan . Y1a* se ha observado en un Nivkh , en un Buriato en Zabaikal , en Mongolia, en un Daur y un chino Han en China, en Corea y en el Tíbet. Y1a con una mutación T16189C adicional es común entre los Nivkhs y entre varios pueblos Tungusic (Hezhen en la República Popular China, Ulchi, Udegey, Even en las cuencas de los ríos Kolyma e Indigirka ). Y1a1 se ha observado en al menos cinco uigures , un kirguís , un Buriato en la República de Buriatia, un Hezhen en China, un Udegey, tres Evenks en Taimyr y dos Yakuts en la República central de Sakha. Se ha observado Y1a2 en los koryaks y en un even de Kamchatka. Y1a parece ser un haplogrupo relativamente joven, con una edad de 6000 (IC del 95 %: 3300 <-> 8800) años estimada a partir de 13 genomas completos (Ulchi x 6, Nivkh x 3, Koryak x 2, Even x 1, Mongolian x 1); sin embargo, esta estimación puede ser relevante solo para el TMRCA de Y1a2 y la mayoría de los haplotipos Y1a* e Y1a-T16189C, ya que no es seguro que ninguno de los ADNmt de Y1a que se han analizado pertenezca al clado Y1a1. [2] (Sin embargo, YFull ha estimado que el TMRCA de todo el clado Y1a, incluidos todos los miembros tabulados de Y1a1 y Y1a*, así como Y1a+T16189C y Y1a2, es de 6.300 [IC del 95 %: 3.800 <-> 9.800] años pb, [22] por lo que la adición de miembros del subclado Y1a1 aparentemente no afecta significativamente la estimación del tiempo hasta el ancestro común más reciente del clado Y1a). Se ha observado Y1b en un tártaro de Buinsk, se ha observado Y1b1 en China y se ha observado Y1b1a en China y en Japón. Se ha estimado que la edad de todo el clado Y1 a partir de 17 genomas completos (incluidos los 13 miembros antes mencionados del clado Y1a más un miembro japonés, uno chino y uno tártaro del clado Y1b más un miembro Khamnigan de Y1*) es de 12 400 (IC del 95 %: 5900 <-> 19 100) años antes del presente. [2]

El Y2a predomina en el área de distribución del sudeste asiático del haplogrupo Y, que se centra en Filipinas y Sumatra . Sin embargo, se ha observado el Y2b en Japón y en un buriato , y se ha observado el Y2* en muestras chinas, japonesas y de Khamnigan.

Árbol

Este árbol filogenético de los subclados del haplogrupo Y se basa en el artículo de Mannis van Oven y Manfred Kayser, Árbol filogenético completo actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano [1] y en investigaciones publicadas posteriormente. [ cita requerida ]

Véase también

Wikimedia Commons tiene medios relacionados con Haplogrupo Y (ADNmt) .

Referencias

  1. ^ ab van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 de octubre de 2008). "Árbol filogenético completo actualizado de la variación global del ADN mitocondrial humano". Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
  2. ^ abc Sukernik, Rem I.; Volodko, Natalia V.; Mazunin, Ilya O.; Eltsov, Nikolai P.; Dryomov, Stanislav V.; Starikovskaya, Elena B. (mayo de 2012). "Diversidad del genoma mitocondrial en los tubáricos, pares y ulquios: contribución a la prehistoria de los siberianos nativos y sus afinidades con los nativos americanos". Revista estadounidense de antropología física . 148 (1): 123–138. doi :10.1002/ajpa.22050. PMID  22487888.
  3. ^ Bermisheva, MA; Kutuev, IA; Spitsyn, VA; Villems, R.; Batyrova, AZ; Korshunova, T. Yu.; Khusnutdinova, EK (enero de 2005). "Análisis de la variación del ADN mitocondrial en la población de oroks". Revista rusa de genética . 41 (1): 66–71. doi :10.1007/PL00022112. PMID  15771254. S2CID  264200417.Traducido de Genetika, Vol. 41, No. 1, 2005, págs. 78–84.
  4. ^ ab Tanaka M, Cabrera VM, González AM, et al. (2004). "Variación del genoma mitocondrial en Asia oriental y el poblamiento de Japón". Genome Research . 14 (10A): 1832–1850. doi :10.1101/gr.2286304. PMC 524407 . PMID  15466285. 
  5. ^ ab Tajima A, Hayami M, Tokunaga K, et al. (2004). "Orígenes genéticos de los ainu inferidos a partir de análisis combinados de ADN de linajes maternos y paternos". Journal of Human Genetics . 49 (4): 187–193. doi : 10.1007/s10038-004-0131-x . PMID  14997363.
  6. ^ Noboru Adachi, Ken-ichi Shinoda, Kazuo Umetsu y Hirofumi Matsumura, "Análisis de ADN mitocondrial de esqueletos de Jomon del sitio Funadomari, Hokkaido, y su implicación para los orígenes de los nativos americanos", American Journal of Physical Anthropology 138:255–265 (2009)
  7. ^ Inoue y otros, 2016
  8. ^ Diversidad de linajes de ADN mitocondrial en el sur de Siberia por Derenko1 et al., Anales de genética humana, volumen 67, número 5, página 391, septiembre de 2003
  9. ^ Yao, Y.-G.; Kong, QP; Wang, CY; Zhu, CL; Zhang, YP. (11 de agosto de 2004). "Diferentes contribuciones matrilineales a la estructura genética de los grupos étnicos en la región de la Ruta de la Seda en China". Biología molecular y evolución . 21 (12): 2265–2280. doi : 10.1093/molbev/msh238 . PMID  15317881.
  10. ^ Mannis van Oven, Johannes M Hämmerle, Marja van Schoor et al. , "Efectos de isla inesperados en un extremo: reducción de la diversidad del cromosoma Y y del ADN mitocondrial en Nias", Molecular Biology and Evolution (2010) doi :10.1093/molbev/msq300
  11. ^ Cho, Sohee; Kim, Moon-Young; Lee, Soong Deok (1 de marzo de 2023). "Origen biogeográfico y características genéticas del poblamiento de la isla de Jeju según marcadores de linaje". Genes y genómica . 45 (3): 307–318. doi :10.1007/s13258-022-01363-5. ISSN  2092-9293. PMID  36607592. S2CID  255467302.
  12. ^ ab Wook Kim, Kicheol Kim, Seung Beom Hong (2014). "Haplogrupos de ADN mitocondrial y homogeneidad en la población coreana".{{cite web}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  13. ^ Wang, Chi-Zao; Yu, Xue-Er; Shi, Mei-Sen; Li, Hui; Ma, Shu-Hua (18 de mayo de 2022). "Análisis del genoma mitocondrial completo de la minoría étnica Daur de Hulunbuir en la Región Autónoma de Mongolia Interior de China". BMC Ecology and Evolution . 22 (1): 66. doi : 10.1186/s12862-022-02019-4 . ISSN  2730-7182. PMC 9118598 . PMID  35585500. 
  14. ^ abcde Cardinali, Irene; Bodner, Martín; Capodiferro, Marco Rosario; Amory, Cristina; Rambaldi Migliore, Nicola; Gómez, Edgar J.; Myagmar, Erdene; Dashzeveg, Tumen; Carano, Francisco; Woodward, Scott R.; Parson, Walther; Perego, Ugo A.; Lancioni, Hovirag; Aquiles, Alessandro (2022). "Huellas de ADN mitocondrial de Eurasia occidental en la Mongolia moderna". Fronteras en genética . 12 . doi : 10.3389/fgene.2021.819337 . ISSN  1664-8021. PMC 8773455 . PMID  35069708. 
  15. ^ abcdefgh Yu-Chun Li, Wei-Jian Ye, Chuan-Gui Jiang, Zhen Zeng, Jiao-Yang Tian, ​​Li-Qin Yang, Kai-Jun Liu, Qing-Peng Kong (2019). "Los valles fluviales dieron forma al paisaje genético materno de los chinos Han".{{cite web}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  16. ^ Yoo, Seong-Keun (2019). "Servidor de imputación de la base de datos de referencia del noreste de Asia (NARD)".
  17. ^ Hwan Young Lee (2006). "Determinación de haplogrupos de ADNmt de Asia oriental en coreanos: análisis de SNP de la región codificante a nivel de haplogrupo y análisis de secuencia de la región de control a nivel de subaplogrupo". Electroforesis . 27 (22): 4408–4418. doi :10.1002/elps.200600151. PMID  17058303. S2CID  28252456.
  18. ^ Jeon, Sungwon; Bhak, Youngjune; Choi, Yeonsong; Jeon, Yeonsu; Kim, Seunghoon; Jang, Jaeyoung; Jang, Jinho; Blazyte, Asta; Kim, Changjae; Kim, Yeonkyung; Calza, Jungae; Kim, Nayeong; Kim, Yeo Jin; Parque, Seung Gu; Kim, Jungeun (29 de mayo de 2020). "Proyecto Genoma Coreano: 1094 genomas personales coreanos con información clínica". Avances científicos . 6 (22): eaz7835. Código Bib : 2020SciA....6.7835J. doi : 10.1126/sciadv.aaz7835. ISSN  2375-2548. PMC 7385432 . PMID  32766443. 
  19. ^ Yamamoto, Kenichi; Sakaue, Saori; Matsuda, Koichi; Murakami, Yoshinori; Kamatani, Yoichiro; Ozono, Keiichi; Momozawa, Yukihide; Okada, Yukinori (5 de marzo de 2020). "Paisaje genético y fenotípico del genoma mitocondrial en la población japonesa". Communications Biology . 3 (1): 104. doi :10.1038/s42003-020-0812-9. ISSN  2399-3642. PMC 7058612 . PMID  32139841. 
  20. ^ "YFull | Variación del genoma mitocondrial en Asia oriental y el poblamiento de Japón". www.yfull.com . Consultado el 12 de marzo de 2024 .
  21. ^ Swapan Mallick, Heng Li, Mark Lipson, et al. , "El proyecto de diversidad genómica de Simons: 300 genomas de 142 poblaciones diversas". Nature 538, 201–206 (13 de octubre de 2016) doi:10.1038/nature18964
  22. ^ YFull MTree 1.02.8328 (al 11 de marzo de 2021)
  23. ^ "Y - MT Tree - TheYtree". www.theytree.com . Consultado el 12 de marzo de 2024 .
  24. ^ Wook Kim; Seung Beom Hong; Kicheol Kim (2014). "Haplogrupos de ADN mitocondrial y homogeneidad en la población coreana". researchgate .

Obras citadas

Enlaces externos