Haplogrupo de ADN del cromosoma Y humano
El haplogrupo S-M230 , también conocido como S1a1b (y anteriormente como S* o K2b1a4), es un haplogrupo de ADN del cromosoma Y. Es, por lejos, el subclado numéricamente más significativo del haplogrupo S1a (y su único subclado primario, el haplogrupo S-P405).
La S-M230 se encuentra comúnmente entre las poblaciones de las tierras altas de Papúa Nueva Guinea (Kayser 2003). También se encuentra en frecuencias más bajas en partes adyacentes de Indonesia y Melanesia . [1] (Kayser 2003 Cox 2006)
Origen
Distribución
Un estudio ha informado del hallazgo del haplogrupo S-M230 en: 52% (16/31) de una muestra de las tierras altas de Papúa Nueva Guinea (PNG); 21% (7/34) de una muestra de las Molucas ; 16% (5/31) de una muestra de la costa de Papúa Nueva Guinea; 12,5% (2/16) de una muestra de Tolai de Nueva Bretaña ; 10% (3/31) de una muestra de Nusa Tenggara , y; 2% (2/89) de una muestra de las tierras bajas/costa de Nueva Guinea Occidental . (Kayser 2003 Cox 2006)
Se ha encontrado un subclado, el haplogrupo S-M226.1 (S1a1b1d1a; anteriormente S1d), en frecuencias bajas en las Islas del Almirantazgo y a lo largo de la costa continental de Papúa Nueva Guinea (Kayser 2008).
Filogenética
Estructura y posición dentro del haplogrupo S
- S1a
- S1a1Z42413
- S1a1a
- S1a1a1 P60, P304, P308
- S1a1a2
- S1a1b M230, P202, P204 – "degradado" en 2016 de su posición anterior como haplogrupo basal S* (y conocido antes de eso como haplogrupo K5)
- S1a1b1 (M254) (anteriormente conocida como K2b1a4a)
- S1a1b1 (M254)
- S1a1b1a (P57)
- S1a1b1b (P61)
- S1a1b1c (P83)
- S1a1b1d (SK1891)
- S1a2 P79, P307
- S1a3 P315
- (Basado en el árbol ISOGG de 2017 , [1] el árbol ISOGG de 2015 , [3] el árbol YCC de 2008 (Karafet 2008) y otras investigaciones publicadas).
Historia
Antes de 2002, existían en la literatura académica al menos siete sistemas de denominación para el árbol filogenético del cromosoma Y. Esto provocó una considerable confusión. En 2002, los principales grupos de investigación se unieron y formaron el Consorcio del Cromosoma Y (YCC) . Publicaron un documento conjunto que creó un único árbol nuevo que todos acordaron utilizar. Más tarde, un grupo de científicos ciudadanos con interés en la genética de poblaciones y la genealogía genética formó un grupo de trabajo para crear un árbol amateur con el objetivo de ser, sobre todo, oportuno. La siguiente tabla reúne todos estos trabajos en el punto del emblemático Árbol YCC de 2002. Esto permite a un investigador que revise la literatura publicada más antigua moverse rápidamente entre nomenclaturas.
Publicaciones de investigación
Los siguientes equipos de investigación por sus publicaciones estuvieron representados en la creación del árbol YCC.
- α Jobling y Tyler-Smith 2000 y Kaladjieva 2001
- β Bajo la colina 2000
- Martillo gamma 2001
- El Karafet 2001
- ε Semino 2000
- El 19 de diciembre de 1999
- Por Capelli 2001
Árbol del YCC 2005
Árbol del YCC 2008
De 2002 a 2008, se conoció como Haplogrupo K5 . [ cita requerida ]
Véase también
Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Haplogrupo S de ADN-Y .
Genética
Subclados S del ADN-Y
Árbol de la estructura principal del ADN-Y
Referencias
- ^ abc Sociedad Internacional de Genealogía Genética (ISOGG; 2017), Árbol de haplogrupos de ADN-Y 2017 (24 de marzo de 2017).
- ^ "Buscar artículos | Revista Europea de Genética Humana". www.nature.com . Consultado el 25 de marzo de 2023 .
- ^ Sociedad Internacional de Genealogía Genética (ISOGG; 2015), Árbol de haplogrupos de ADN-Y 2015. (Fecha de acceso: 1 de febrero de 2015.)
Notas al pie
Obras citadas
- Cox, Murray P.; Mirazón Lahr, Marta (2006). "La diversidad del cromosoma Y está inversamente asociada con la afiliación lingüística en comunidades de habla austronesia y papú de las Islas Salomón". American Journal of Human Biology . 18 (1): 35–50. doi :10.1002/ajhb.20459. PMID 16378340. S2CID 4824401.
- Karafet, TM; Méndez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008). "Nuevos polimorfismos binarios remodelan y aumentan la resolución del árbol de haplogrupos del cromosoma Y humano". Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID 18385274.
- Kayser, Manfred; Brauer, Silke; Weiss, Gunter; Schiefenhövel, Wulf; Underhill, Peter; Shen, Peidong; Oefner, Peter; Tommaseo-Ponzetta, Mila; Stoneking, Mark (2003). "Diversidad reducida del cromosoma Y, pero no del ADN mitocondrial, en poblaciones humanas de Nueva Guinea occidental". The American Journal of Human Genetics . 72 (2): 281–302. doi :10.1086/346065. PMC 379223 . PMID 12532283.
- Kayser, M.; Choi, Y.; Van Oven, M.; Mona, S.; Brauer, S.; Trent, RJ; Suarkia, D.; Schiefenhovel, W.; Stoneking, M. (2008). "El impacto de la expansión austronesia: evidencia del ADNmt y la diversidad del cromosoma Y en las islas del Almirantazgo de Melanesia". Biología molecular y evolución . 25 (7): 1362–74. doi : 10.1093/molbev/msn078 . PMID 18390477.
- Mona, S.; Tommaseo-Ponzetta, M.; Brauer, S.; Sudoyo, H.; Marzuki, S.; Kayser, M. (2007). "Los patrones de diversidad del cromosoma Y se entrecruzan con la hipótesis Trans-Nueva Guinea". Mol. Biol. Evol . 24 (11): 2546–55. doi : 10.1093/molbev/msm187 . PMID: 17846104.
- Scheinfeldt, L.; Friedlaender, F; Friedlaender, J; Latham, K; Koki, G; Karafet, T; Hammer, M; Lorenz, J (2006). "Variación inesperada del cromosoma NRY en la isla norte de Melanesia". Biología molecular y evolución . 23 (8): 1628–41. doi : 10.1093/molbev/msl028 . PMID 16754639.
Fuentes para las tablas de conversión
- Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (febrero de 2001). "Una herencia paterna predominantemente indígena para los pueblos de habla austronesia del sudeste asiático insular y Oceanía". The American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–443. doi :10.1086/318205. PMC 1235276 . PMID 11170891.
- Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd, Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (1 de julio de 2001). "Patrones jerárquicos de la diversidad global del cromosoma Y humano". Biología molecular y evolución . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID 11420360.
- Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000), "Nuevos usos para nuevos haplotipos", Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
- Kaladjieva, Luba; Calafell, Francesc; Jobling, Mark A; Angelicheva, Dora; et al. (febrero de 2001). "Patrones de diversidad genética inter e intragrupal en el Vlax Roma revelados por los linajes del cromosoma Y y el ADN mitocondrial". Revista Europea de Genética Humana . 9 (2): 97–104. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID 11313742. S2CID 21432405.
- Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (septiembre de 2001). "Historia de la población paterna de Asia oriental: fuentes, patrones y procesos microevolutivos". The American Journal of Human Genetics . 69 (3): 615–628. doi : 10.1086/323299 . PMC 1235490 . PMID 11481588.
- Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), "El legado genético del Homo sapiens sapiens paleolítico en los europeos actuales: perspectiva del cromosoma AY", Science , 290 (5494): 1155–9, Bibcode :2000Sci...290.1155S, doi :10.1126/science.290.5494.1155, PMID 11073453
- Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; et al. (diciembre de 1999). "Evidencia del cromosoma Y de una migración hacia el norte de los humanos modernos hacia Asia oriental durante la última Edad de Hielo". The American Journal of Human Genetics . 65 (6): 1718–1724. doi :10.1086/302680. PMC 1288383 . PMID 10577926.
- Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (noviembre de 2000). "Variación de la secuencia del cromosoma Y y la historia de las poblaciones humanas". Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
Lectura adicional
- Haber, Marc; Platt, Daniel E.; Ashrafian Bonab, Maziar; Youhanna, Sonia C.; Soria-Hernanz, David F.; Martínez-Cruz, Begoña; Douaihy, Bouchra; Ghassibe-Sabbagh, Michella; et al. (2012). Kayser, Manfred (ed.). "Los grupos étnicos de Afganistán comparten una herencia cromosómica Y estructurada por eventos históricos". PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode :2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552.
- Karafet, Tatiana M.; Lansing, JS; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, SPK; Arthawiguna, WA; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; et al. (2005). "Perspectiva balinesa del cromosoma Y en el poblamiento de Indonesia: contribuciones genéticas de los cazadores-recolectores preneolíticos, los agricultores austronesios y los comerciantes indios". Biología humana . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID 16114819. S2CID 7953854.
- Kayser, M.; Brauer, S.; Cordaux, R.; Casto, A.; Lao, O.; Zhivotovsky, LA; Moyse-Faurie, C.; Rutledge, RB; et al. (2006). "Orígenes melanesios y asiáticos de los polinesios: gradientes de ADNmt y cromosoma Y en el Pacífico". Biología molecular y evolución . 23 (11): 2234–44. doi : 10.1093/molbev/msl093 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-0145-0 . PMID 16923821.
Filogenética