La Guerra Civil Peruana de 1843-1844 fue el segundo conflicto interno en el Perú del siglo XIX (después de la Guerra Civil Peruana de 1834 ). Se libró entre las fuerzas gubernamentales de Vivanco y Echenique contra los revolucionarios liderados por Domingo Nieto y Ramón Castilla. Se libró una batalla en Pachia en Tacna el 29 de agosto de 1843. Se produjo un enfrentamiento en San Antonio, Moquegua el 27 de octubre de 1843. Domingo Nieto murió el 17 de febrero de 1844. Del 17 al 29 de junio de 1844, se produjeron combates en la capital, Lima, entre el gobierno y los partidarios de Domingo Elías . Un enfrentamiento final se produjo en Carmen Alto el 22 de julio de 1844.
Tras la muerte del presidente peruano Agustín Gamarra durante la guerra con Bolivia en 1841, asumió el poder el presidente del Consejo de Estado, Manuel Menéndez . Tras contener la invasión boliviana al sur del Perú y firmar la paz con el país vecino, Menéndez acabó siendo derrocado. Perú se vio entonces sumido en un periodo conocido posteriormente como la militar , donde varios generales se disputaron el poder. Tras sucesivos golpes de Estado, llegaron al poder Juan Crisóstomo Torrico , Juan Francisco de Vidal y Manuel Ignacio de Vivanco . Este último instauró un gobierno autoritario y conservador , al que llamó el Directorio .
Los generales Domingo Nieto , Ramón Castilla y Manuel de Mendiburu se propusieron acabar con el gobierno de facto de Vivanco y restaurar la autoridad legítima, es decir, la de Menéndez. Como su objetivo era restablecer la Constitución de 1839 el levantamiento se denominó « Revolución Constitucional », la misma que se inició en Tacna el 17 de mayo de 1843. Se organizaron milicias en Tacna y Moquegua , para apoyar la revolución, uniéndose a ellas algunas unidades del ejército regular.
Vivanco envió una división al sur del Perú al mando de su ministro de guerra, el general Manuel de la Guarda, para reforzar las guarniciones que ya existían en esa zona, con la consigna de acabar sin vacilaciones con los «faccionistas». Guarda desembarcó en Islay y marchó a Arequipa , donde se unió a las fuerzas del general Fermín del Castillo Antes de continuar la marcha hacia Tacna, ambos se encargaron de someter a los generales Juan Crisóstomo Torrico y Miguel de San Román, que se habían sublevado en Puno . Una vez firmada la capitulación, Torrico y San Román se dirigieron a Bolivia . Vivanco se irritó al conocer esta noticia, reprendiendo duramente a Guarda por no haber capturado y fusilado a los rebeldes.
Dispersados los rebeldes de Puno, las tropas de la jefatura avanzaron sobre Tacna. Nieto y Castilla, al frente de milicianos rebeldes de Tacna y Moquegua, atrajeron al coronel Juan Francisco Balta, jefe vivanquista que con un pequeño destacamento se había alejado del grueso de su ejército. Así, el 29 de agosto de 1843 se libró la batalla de Pachía , cerca de Tacna. Nieto atacó a Balta, pero luego fingió retirarse para atraer a la caballería enemiga y a su jefe a un lugar distante de su infantería. Balta cayó en la trampa, que aprovechó Castilla para atacar a la infantería enemiga y tomar posiciones en un cementerio. Al regreso de Balta, recibió las andanadas cerradas de los fusileros de Castilla, mientras Nieto, dejando la farsa de retirarse de él, contraatacó por detrás. La hábil maniobra determinó la derrota de Balta, que perdió más de 500 hombres, entre soldados y oficiales.
Las fuerzas de Guarda y Castillo se mantuvieron en pie, sumando unos 3.200 hombres. Se enfrentaron a las fuerzas de Nieto y Castilla el 27 de octubre de 1843, cerca de Moquegua. La batalla, conocida como batalla de San Antonio , comenzó en las alturas de Tumilaca, y los constitucionalistas obligaron a sus oponentes a pasar la noche sin agua y con las armas puestas. Al amanecer del día siguiente, Guarda tenía acampadas sus tropas cerca de un arroyo. Atento a este movimiento, Castilla avanzó completamente solo hasta el campamento enemigo y entró en la tienda de Guarda, a quien le ofreció capitular (lo que sólo fue una simulación). Tras acordar los términos de la capitulación, Castilla sugirió a Guarda que dejara descansar a sus tropas para que pudieran ir a beber al arroyo. El propio Castilla, saliendo de la tienda, se dirigió a estas tropas y con voz estentórea les ordenó: «Batallón: montad pabellones y salid del agua». Los soldados de Guarda obedecieron, como si hubieran escuchado a su propio jefe. Fue entonces el momento oportuno para que entraran en acción los soldados castellanos, quienes, avanzando al trote, cercaron la tienda de Guarda, mientras Castilla entraba y tomaba del brazo al jefe vivanquista, diciéndole: "Eres mi prisionero". Los soldados de Guarda, como estaban desarmados, fueron hechos prisioneros fácilmente. Esta fue una gran victoria para los constitucionalistas, quienes, en su mayoría milicianos, sometieron a un ejército de soldados experimentados, superiores en número. Como consecuencia de esta victoria, la rebelión avanzó hacia Puno, Cuzco y Andahuaylas , consolidándose así en todo el sur del Perú, con excepción de Arequipa, que se mantuvo inquebrantable en su lealtad a Vivanco.
El 3 de septiembre de 1843 los revolucionarios constituyeron una Junta de Gobierno Provisional de los Departamentos Libres en el Cuzco , cuya presidencia asumió Domingo Nieto. Estaba integrada por el general Ramón Castilla, el coronel Pedro Cisneros el doctor José M., el coronel Zegarra y el coronel de la Guardia Nacional Nicolás Jacinto Chocano. El secretario y vocal suplente era el coronel José Félix Iguaín . figura representativa de los revolucionarios era el mariscal Nieto, apodado el « Quijote de la Ley» y el «Mariscal grecorromano» , por su apego a las leyes y por su vasta cultura. Pero enfermó y murió el 17 de febrero de 1844, víctima de una enfermedad hepática. Como tal muerte se produjo de manera inesperada, pues Nieto apenas contaba con 40 años, hubo quienes sospecharon un posible envenenamiento. Castilla reemplazó a Nieto en la presidencia de la Junta, pasando así a liderar la revolución. Vivanco, al ver que su situación se complicaba, marchó hacia Arequipa, donde contaba con un apoyo masivo.
Otro episodio de la guerra fue la llamada Semana Magna de Lima . Todo comenzó cuando el prefecto Domingo Elías , hasta entonces leal a Vivanco, aprovechando su salida, se alzó contra el gobierno directoral y se autoproclamó Jefe Político y Militar de la República el 17 de junio de 1844. Inmediatamente después, Elías organizó la defensa de la capital ante la amenaza de las fuerzas vivanquistas comandadas por José Rufino Echenique , que avanzaban desde la sierra central . Lima entera se movilizó para defenderse, pero tras una semana de tensa espera, el ataque no se produjo porque Echenique, según relata en sus memorias, fue informado por Felipe Pardo y Aliaga de que Vivanco y Castilla se preparaban para una batalla final cerca de Arequipa, lo que hacía inútil un ataque a Lima. Así terminó la Semana Magna , episodio recordado como una expresión del hartazgo o hastío de la población limeña ante el militarismo.
Vivanco, que sí se encontraba en Arequipa, quiso dimitir al conocer la noticia de la deserción de Elías, pero ante las súplicas de la multitud arequipeña desistió. Arequipa era muy devota de su causa y estaba preparada para resistir el ataque de Castilla.
Castilla, reforzada con las fuerzas de Miguel de San Román, sitió Arequipa, con intercambio de fuego entre ambos bandos durante 16 días. Más tarde, en la noche del 21 de julio de 1844, Castilla tomó la ofensiva y avanzó sobre el flanco derecho de Vivanco, amaneciendo en Acequia Alta o Carmen Alto.
Vivanco, que fue precedido por varias partidas de montoneros , se situó en el pueblo de Cayma y estableció allí su línea de defensa, cediendo la iniciativa al enemigo en esta parte.
En Carmen Alto, un pequeño poblado rodeado de una llanura ubicado entre Cayma y Yanahuara , se encontraba desplegado el ejército de Castilla, resguardado por las irregularidades del terreno, y aguardaba el ataque de sus adversarios. Castilla asumió el mando de sus tropas y nombró general en jefe al general Miguel de San Román y de Estado Mayor al general Isidro Frisancho.
El decano Juan Gualberto Valdivia historiador de las revoluciones de Arequipa, cuenta una anécdota sobre esta batalla: afirma que Vivanco, en el momento en que se desató la lucha, estaba ocupado tratando de descifrar la inscripción del año en que se había colocado la campana de la iglesia de Cayma, monumento de valor histórico. Durante esa época sufrió la derrota de Carmen Alto y con ello perdió el poder. Pero más creíble es la versión vivanquista , que sostiene que Vivanco estaba en el campanario de esa iglesia para observar el campo de operaciones y que había dispuesto que la batalla se librara al día siguiente, pero la imprudencia de uno de sus oficiales precipitó la lucha.
En efecto, el 22 de julio de 1844, Vivanco ordenó a sus lugartenientes Juan Antonio Pezet , Ríos y Lopera que colocaran las tropas en posiciones aparentes para presentar la batalla el 23 de julio, al día siguiente. Pero Lopera excedió los límites en el cumplimiento de las órdenes y con el primer cuerpo que movió inició el ataque a la línea enemiga. Cuando Vivanco y otros jefes que estaban con él a lo lejos notaron la batalla que se desarrollaba, decidieron marchar al lugar de la batalla, pero ya era demasiado tarde: sus batallones habían sido destruidos. El propio Pezet resultó gravemente herido. Al ponerse el sol, Vivanco ordenó a sus tropas sobrevivientes que abandonaran el campo. Castilla suspendió la persecución a las siete de la noche y su ejército se concentró en Challapampa, donde esperó el amanecer para entrar en la ciudad.
A la mañana siguiente, Castilla entró en la ciudad y envió al doctor Juan Manuel Polar y Carasas tratar con Vivanco, ofreciéndole garantías. Vivanco, que había apostado sus tropas en el cementerio de Apacheta, se negó a todo. Y en la tarde de ese mismo día partió a todo galope hacia el puerto de Islay donde se embarcó en un vapor mercante. Arribó al Callao el 27 de julio, siendo apresado por Domingo Elías y desterrado a Chile pocos días después. Poco antes, la escuadra se había unido al bando vencedor.
Castilla fue magnánimo con los vencidos y no aplicó represión alguna. El pueblo arequipeño, que había apoyado fervientemente a Vivanco (como también lo haría en la guerra civil de 1856-1858 ), aceptó el nuevo orden de cosas, dado que su líder no mostró interés en continuar la lucha y más bien huyó, abandonando sus tropas.
Victorioso en el campo de batalla, Castilla cumplió con restablecer la Constitución de 1839. En consecuencia, y tras un breve interinstitucional de Justo Figuerola , el presidente del Consejo de Estado Manuel Menéndez reasumió el mando supremo el 7 de octubre de 1844, con la misión de llevar a cabo el traspaso constitucional del poder.
Menéndez cumplió con convocar a elecciones generales El ganador fue Castilla, quien asumió el poder el 20 de abril de 1845. Este primer gobierno de Castilla (1845-1851), significó el inicio de una etapa de calma institucional y de organización del Estado peruano, luego de dos décadas de conflicto interno.